蝙蝠冠状病毒HKU3
蝙蝠冠状病毒HKU3
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病毒分类 
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| （未分级）： | 病毒 Virus |
| 域： | 核糖病毒域 Riboviria |
| 界： | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
| 门： | 小核糖病毒门 Pisuviricota |
| 纲： | 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes |
| 目： | 套式病毒目 Nidovirales |
| 科： | 冠状病毒科 Coronaviridae |
| 属： | 乙型冠状病毒属 Betacoronavirus |
| 亚属： | SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus |
| 种： | |
| 毒株： | 蝙蝠冠状病毒HKU3 HKU3病毒
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蝙蝠冠状病毒HKU3（BtCoV HKU3；Bat-SARS-CoV HKU3）属严重急性呼吸道综合征相关冠状病毒（SARSr-CoV），为SARS-CoV相关病毒，在中华菊头蝠样本中发现，是第一个在蝙蝠中发现的SARS相关病毒[1]。HKU3包含13个病毒株，其中HKU3-1、HKU3-2与HKU3-3于2005年发表，在香港的中华菊头蝠中发现；HKU3-4至HKU3-13于2010年发表，在香港与广东的中华菊头蝠样本中发现。
发表与研究
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2004年至2005年，香港大学的研究人员在香港各地采集动物样本，发现中华菊头蝠样本中含有与SARS-CoV相似的冠状病毒，经全基因组定序得到HKU3-1、HKU3-2与HKU3-3等三个病毒株[2][3]，是首次在蝙蝠样本中发现SARS相关病毒，此前仅知果子狸、貉与鼬獾带有SARS病毒[1][注 1]。HKU3-1、3-2与3-3的基因组约长29700nt，其序列与SARS-CoV相似度为88%，大部分差异位于刺突蛋白（S）、ORF3与ORF8，其中尤以ORF8差异最大，与果子狸SARS病毒一样比人类SARS病毒多了一段长29nt的插入序列（但此29个核酸与果子狸病毒的不完全相同），形成一完整的长开放阅读框，而人类SARS病毒的ORF8则是被分成8a与8b等2个较小的开放阅读框[5]。
2010年，又有10个与此三个病毒株相近的新病毒株被发表，即为HKU3-4至HKU3-13，基因组长度介于29677nt至29716nt之间，这些病毒株来自2004年至2008年采集的中华菊头蝠样本，其中HKU3-7与HKU3-8来自广东的个体，其他则来自香港的个体，香港的8个毒株彼此序列非常接近（相似度99.9%），和广东的毒株相似度则为98.5%，这10个新病毒株与2005年发表的3个病毒株共同组成一个演化支。除HKU3-8外的9个病毒株的ORF8皆与果子狸SARS病毒、HKU3-1、3-2与3-3一样是一个完整的长开放阅读框，HKU3-8在此处则有一段长26nt的缺失（在人类SARS病毒29nt缺失的附近），将ORF8分为3个较小的开放阅读框[6]。
HKU3与许多蝙蝠SARSr-CoV一样在刺突蛋白的受体结合结构域（receptor binding domain, RBD）有两段分别长5和12个氨基酸的序列缺失（但不见于WIV1病毒与SHC014病毒）[7]
演化树
[编辑]截至2021年1月[update]，SARS-CoV与相关病毒株的系统发生树：
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SARS-CoV-2 79 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
蝙蝠病毒
果子狸病毒
人类病毒
注脚
[编辑]参考文献
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- ^ 1.0 1.1 1.2 1.3 1.4 Ge, Xing-Yi; Hu, Ben; Shi, Zheng-Li. Bat Coronaviruses. Wang, Lin-Fa (编). Bats and Viruses. Hoboken, NJ: John Wiley & Sons, Inc. 2015-06-26: 127–155. ISBN 978-1-118-81882-4. doi:10.1002/9781118818824.ch5 （英语）.
- ^ Bat SARS coronavirus HKU3. NCBI Taxonomy Browser.
- ^ Bat coronavirus HKU3 (BtCoV) (SARS-like coronavirus HKU3). Uniprot. [2021-01-24]. （原始内容存档于2021-04-13）.
- ^ 4.0 4.1 4.2 Li, Wendong; Shi, Zhengli; Yu, Meng; Ren, Wuze; Smith, Craig; Epstein, Jonathan H.; Wang, Hanzhong; Crameri, Gary; Hu, Zhihong; Zhang, Huajun; Zhang, Jianhong. Bats Are Natural Reservoirs of SARS-Like Coronaviruses. Science. 2005-10-28, 310 (5748). ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.1118391 （英语）.
- ^ Lau, S. K. P.; Woo, P. C. Y.; Li, K. S. M.; Huang, Y.; Tsoi, H.-W.; Wong, B. H. L.; Wong, S. S. Y.; Leung, S.-Y.; Chan, K.-H.; Yuen, K.-Y. Severe acute respiratory syndrome coronavirus-like virus in Chinese horseshoe bats. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2005, 102 (39): 14040–14045. ISSN 0027-8424. doi:10.1073/pnas.0506735102.
- ^ Lau, Susanna K. P.; Li, Kenneth S. M.; Huang, Yi; Shek, Chung-Tong; Tse, Herman; Wang, Ming; Choi, Garnet K. Y.; Xu, Huifang; Lam, Carol S. F.; Guo, Rongtong; Chan, Kwok-Hung; Zheng, Bo-Jian; Woo, Patrick C. Y.; Yuen, Kwok-Yung. Ecoepidemiology and Complete Genome Comparison of Different Strains of Severe Acute Respiratory Syndrome-Related Rhinolophus Bat Coronavirus in China Reveal Bats as a Reservoir for Acute, Self-Limiting Infection That Allows Recombination Events. Journal of Virology. 2010, 84 (6): 2808–2819. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.02219-09.
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