De marathon van Praag 1998 werd gelopen op zondag 24 mei 1998. Het was de vierde editie van de marathon van Praag. De Keniaan Elijah Lagat kwam bij de mannen als eerste over de streep in 2:08.52. Met deze overwinning won hij $ 29.000 aan prijzengeld. De Wit-Russische Elena Vinitskaya won net als de twee vorige edities bij de vrouwen in 2:34.25.

Deze editie was eveneens het toneel van de Tsjechische kampioenschappen. Deze titels werden gewonnen door respectievelijk Pavel Kryska (tiende in 2:17.13) bij de mannen en Karla Malisova (elfde in 3:00.33) bij de vrouwen.

In totaal finishten 2222 marathonlopers, waarvan 233 vrouwen.

rang	naam	land	tijd
1	Elijah Lagat	KEN	2:08.52
2	Samson Kandie	KEN	2:09.10
3	Ezael Tlhobo	RSA	2:09.54
4	Leonid Shvetsov	RUS	2:11.52
5	Eduard Tukhbatullin	RUS	2:15.42
6	Abel Gisemba	KEN	2:15.45
7	Vladimir Kotov	BLR	2:15.48
8	Badine El Miloudi	MAR	2:16.13
9	Nicolas Kioko	KEN	2:16.31
10	Pavel Kryška	CZE	2:17.13
11	Janos Szeman	HUN	2:17.25
12	Alfredo Luserreta	ESP	2:17.33
13	Jan Blaha	CZE	2:18.44
14	Simon Chirchir	KEN	2:18.56
15	Yrjö Pesonen	FIN	2:18.58
16	Petr Klimes	CZE	2:19.20
17	Jesse Maina	KEN	2:19.23
18	Stephenson Nyamu	KEN	2:20.08
19	Petr Novák	CZE	2:20.27
20	Petr Pipa	SVK	2:21.17
21	Jackson Kipngok	KEN	2:21.58
22	Simon Mphulanyane	RSA	2:23.10
24	Ambrose Makau	KEN	2:27.32

rang	naam	land	tijd
1	Elena Vinitskaya	BLR	2:34.25
2	Irina Permitina	RUS	2:36.21
3	Franziska Moser	SUI	2:37.53
4	Agnes Jakab	HUN	2:38.08
5	Elena Tsukhlo	BLR	2:41.24
6	Valentina Santalova	KAZ	2:47.06
7	Anna Balosakova	SVK	2:47.44
8	Ida Kovacs	HUN	2:47.56
9	Maria-Luisa Boselli	ITA	2:53.46
10	Ludmila Melicherova	SVK	2:55.36
11	Karla Malisova	CZE	3:00.22
12	Annelli Sodergards	SWE	3:00.33
13	Petra Havlova	CZE	3:06.20
14	Tana Metelkova	CZE	3:06.44
18	Ivana Martincova	CZE	3:09.43