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降解物激活蛋白.
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代謝產物活化蛋白(CAP,Catabolite activator protein),也稱為cAMP受體蛋白(CRP,cAMP Receptor Protein),為一種轉錄促進劑,以同型二聚體的方式存在。其在結合上DNA時會同時彎曲DNA結構,促進RNA聚合酶的結合,加快轉錄速度。
其結合在乳糖操作子的啟動子上後,會促進該操作子的轉錄。
包含N端的配體鍵結區(CAPN,殘基 1-138),使蛋白形成二聚體,以及包含C端的DNA鍵結區(DBD, 殘基 139-209)。
藉由增加DNA蛋白的親和性,使兩個cAMP(環腺甘酸)分子鍵結於帶有變構效應的負協同性和功能的CAP二聚體。當只有少量葡萄糖進入細胞中,則cAMP的濃度提升。
CAP有一種螺旋-轉角-螺旋的結構,使他能成功鍵結於DNA的主要區位。兩種螺旋互相加強,造成一個43°的轉角結構,所以最後造成DNA 94°的轉角。
這種情況使DNA分子打開,使RNA聚合酶可以鍵結上來,轉譯出乳糖分解的基因。cAMP-CAP對於乳糖操作子轉錄是必要的條件。
CAP主要功能為代謝產物的抑制,為一個典型的例子。
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| (1) 碱性结构域 |
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| | 转录激活因子( AATF、 1、2、3、4、5、6、7) · AP-1(c-Fos、 FOSB、FOSL1、FOSL2、c-Jun、JUNB、JUND) · BACH(1、2) · BATF · BLZF1 · C/EBP( α、 β、 γ、 δ、ε、ζ) · CREB(1、3、L1) · CREM · DBP · DDIT3 · GABPA · Gcn4 · HLF · MAF(B、F、G、K) · NFE(2、L1、L2、L3) · NFIL3 · NRL · NRF(1、2、3) · XBP1 |
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| | ATOH1 · AhR · AHRR · ARNT · ASCL1 · BHLHB2 · BMAL(ARNTL、ARNTL2) · CLOCK · EPAS1 · HAND(1、2) · HES(5、6) · HEY(1、2、L) · HES1 · HIF(1A、3A) · ID(1、2、 3、4) · LYL1 · MXD4 · MYCL1 · MYCN · Neurogenins(1、2、3 · 肌形成调节因子(MyoD、成肌蛋白、MYF5、MYF6) · NeuroD( 1、2) · NPAS(1、2、3) · OLIG(1、2) · Pho4 · Scleraxis · TAL(1、2) · Twist · USF1 |
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| (1.3)bHLH-ZIP | AP-4 · MAX · MITF · MNT · MLX · MXI1 · Myc · SREBP(1、2) |
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| (1.4) NF-1 | NFI(A、B、C、X) · SMAD(R-SMAD(1、2、3、5、9) - I-SMAD(6、7) - 4) |
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| (1.5) RF-X | RFX(1、2、3、4、5、ANK) |
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| | AP-2(α、β、γ、δ、ε) |
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| | 第一亚族: 甲状腺激素受体( α、 β)、CAR、 FXR、 LXR(α、β)、 PPAR( α、β/δ、 γ)、PXR、RAR( α、β、γ)、 ROR(α、β、γ)、 Rev-ErbA(α、β)、VDR 第二亚族( COUP-TF(I、II)、 Ear-2、 HNF4(α、γ)、PNR、RXR(α、β、γ)、Testicular receptor(2、4)、TLX) 第三亚族( 甾类激素( 雄激素、雌激素(α、β)、 糖皮质激素、盐皮质激素、 孕酮)、 雌激素相关(α、β、γ)) 第四亚族 NUR(NGFIB、NOR1、NURR1) · 第五亚族LRH-1、 SF1 · 第六亚族 GCNF · 第零亚族DAX1、 SHP |
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| (2.2) 其他的Cys4结构 | GATA(1、2、3、4、5、6) · MTA(1、2、3) · TRPS1 |
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| (2.3) Cys2His2 | 通用转录因子(TFⅡA、TFⅡB、TFIID、TFⅡE、TFⅡF(1、2)、TFⅡH(1、2、4、2I、3A、3C1、3C2)) ATBF1 · BCL(6、11A、11B) · CTCF · E4F1 · EGR(1、 2、 3、 4) · ERV3 · GFI1 · GLI-Krüppel family(1、2、3、REST、S2、YY1) · HIC(1、2) · HIVEP(1、2、3) · IKZF(1、2、3) · ILF(2、3) · Sp/KLF家族( KLF:1、2、3、 4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、17, SP:1、2、4、7、 8) · MTF1 · MYT1 · OSR1 · · WT1 · Zbtb7(7A、7B) · ZBTB(16、17、20、32、33、40) · zinc finger(3、7、9、10、19、22、24、33B、 34、35、41、43、44、51、74、143、146、148、165、202、217、219、238、239、259、267、268、281、295、318、330、346、350、365、366、384、 423、451、452、471、593、638、649、655) |
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| (2.4) Cys6 | HIVEP1 |
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| (2.5)交替composition | AIRE · DIDO1 · GRLF1 · ING(1、2、4) · JARID(1A、1B、1C、1D、2) · JMJD1B |
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| | WRKY转录因子家族 |
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| | ARX · CDX( 1、2) · CRX · CUTL1 · DBX(1、2) · DLX(3、4、5) · EMX2 · EN(1、2) · FHL(1、2、3) · HESX1 · HHEX · HLX · 同源框(A1、A2、A3、A4、A5、A7、A9、A10、A11、A13、B1、B2、B3、B4、B5、B6、B7、B8、B9、B13、C4、C5、C6、C8、C9、C10、C11、C13、D1、D3、D4、D8、D9、D10、D11、 D12、D13) · HOPX · IRX(1、2、3、4、5、6、MKX) · LMX(1A、1B) · MEIS(1、2) · MEOX2 · MNX1 · MSX( 1、2) · NANOG · NKX(2-1、2-2、2-3、2-5、3-1、3-2、6-1、6-2) · PBX(1、2、3) · PHF(1、3、6、8、10、16、17、20、21A) · PITX(1、 2、3) · POU结构域(PIT-1、BRN-3: A、B、C、 八聚体转录因子:1、2、 3/4、6、7、11) · OTX(1、2) · PDX1 · ZEB( 1、2) |
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| (3.2)配对框 | PAX(1、2、3、4、5、6、7、8、9) |
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| (3.3)叉头状/翼状螺旋 | E2F( 1、2、3、4、5) · FOX proteins(C1、C2、D3、E1、G1、H1、K2、L2、 M1、N3、O1、O3、O4、P1、 P2、 P3) |
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| (3.4)热休克因子 | HSF(1、2、4) |
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| (3.5)色氨酸簇 | ELF(2、4、5) · EGF · ELK(1、3、4) · ERF · ERG · ETS(1、 2、SPIB) · ETV(1、4、5、6) · FLI1 · Interferon regulatory factors(1、2、3、4、5、6、7、8) · MYB · MYBL2 |
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| (3.6)TEA结构域 | transcriptional enhancer factor(1、2、3、4) |
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| | (4) 具有小凹槽触点的β-支架因子 |
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| (4.1) Rel homology region | NF-κB(NFKB1、NFKB2、REL、RELA、RELB) · NFAT(C1、C2、C3、C4、5) |
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| (4.3) p53样转录因子 | |
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| | Mef2(A、B、C、D) · SRF |
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| | BBX · HMGB( 1、 2、 3、 4) · HMGN、( 1、 2、 3、 4) · HNF(1A、1B) · SOX(1、 2、3、4、5、6、8、 9、10、11、12、13、14、15、18、21、 SRY) · SSRP1 · TCF/LEF家族( TCF(1、3、4) · LEF1) · TOX(1、2、3、4) |
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| (4.9) Grainyhead | TFCP2 |
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| (4.10) 冷休克域 | CSDA、YBX1 |
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| (4.11) Runt | CBF(CBFA2T2、CBFA2T3、RUNX1、RUNX2、RUNX3、RUNX1T1) |
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| | (0) 其他转录因子 |
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| (0.2) HMGI(Y) | |
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| (0.5) AP-2/EREBP-related factors | Apetala 2 · EREBP · B3(ARF · ABI3 · RAV) |
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| (0.6) Miscellaneous | ARID(1A、1B、2、3A、3B、4A) · CAP · IFI(16、35) · MLL(2、3、T1) · MNDA · NFY(A、B、C) · ρ因子/ σ因子 |
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