第35回全国大学ラグビーフットボール選手権大会（だい35かいぜんこくだいがくラグビーフットボールせんしゅけんたいかい）は1998年12月19日から1999年1月15日にかけて開催された^[1]全国大学ラグビーフットボール選手権大会である。関東学院大学が2年連続2回目の優勝を果たした。

決勝戦は2年連続で関東学院大学と明治大学で争われ、関東学院大学が47-28で2連覇を果たした。

• 1998年12月19日・12月20日 - 1回戦
• 1998年12月26日・12月27日 - 2回戦
• 1999年1月2日 - 準決勝
• 1999年1月15日 - 決勝

• 国立競技場（準決勝・決勝）
• 秩父宮ラグビー場（1回戦・2回戦）
• 花園ラグビー場（1回戦・2回戦）
• 瑞穂公園ラグビー場（1回戦）
• 平和台競技場（1回戦）

• 明治大学（関東大学対抗戦1位・14年連続28回目）
• 慶應義塾大学（関東大学対抗戦2位・13年振り16回目）
• 早稲田大学（関東大学対抗戦3位・15年連続32回目）
• 筑波大学（関東大学対抗戦4位・4年連続7回目）
• 日本体育大学（関東第5代表・6年連続19回目）
• 法政大学（関東大学リーグ戦1位・7年連続16回目）
• 関東学院大学（関東大学リーグ戦2位・9年連続9回目）
• 中央大学（関東大学リーグ戦3位・2年振り9回目）
• 日本大学（関東大学リーグ戦4位・5年連続9回目）
• 流通経済大学（関東大学リーグ戦5位・2年連続2回目）
• 京都産業大学（関西大学リーグ1位・14年連続16回目）
• 大阪体育大学（関西大学リーグ2位・10年連続15回目）
• 同志社大学（関西大学リーグ3位・25年連続34回目）
• 龍谷大学（関西大学リーグ4位・6年連続6回目）
• 中京大学（関西第5代表・3年振り14回目）
• 福岡大学（九州学生リーグ1位・3年連続13回目）

• 試合開始時間は日本標準時である。
• 3位決定戦は行われない。

• 全国大学ラグビーフットボール選手権大会