Agama di Azerbaijan utamanya adalah Islam; sekitar 97% penduduk Azerbaijan menganut agama tersebut.^[1] Sekitar 85% umat Muslim di Azerbaijan beraliran Syiah dan 15% Sunni.^[2] Azerbaijan adalah negara dengan penganut Muslim Syiah terbesar kedua di dunia, setelah Iran.^[3] Namun, Azerbaijan sendiri dianggap sebagai negara Muslim yang paling sekuler di dunia.^[4] Menurut Pasal 48 Undang-undang Dasar Azerbaijan, Azerbaijan adalah negara sekuler yang menjamin kebebasan beragama. Selain itu, menurut hasil survei tahun 2006–2008 yang dilakukan oleh Gallup, hanya 21% responden Azerbaijan yang menyatakan bahwa agama memainkan peranan penting dalam kehidupan mereka.^[5]

Azerbaijan juga memiliki kelompok minoritas agama, dan diperkirakan terdapat 280.000 jiwa umat Kristen (3,1% populasi) di negara ini.^[6] Sebagian besar menganut aliran Ortodoks Rusia dan Ortodoks Georgia, walaupun di wilayah Nagorno-Karabakh juga terdapat pengikut aliran Apostolik Armenia.^[7] Di Azerbaijan juga terdapat umat Yahudi dengan sejarah yang dapat ditilik kembali ke 2.000 tahun yang lalu dan diperkirakan terdapat 12.000 orang penganut Yahudi di Azerbaijan saat ini.^{[8][9][10][11]}