CCDC25
| CCDC25 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasi | CCDC25 | ||||||||||||||||||||||||
| Vanjski ID-jevi | MGI: 1914429 HomoloGene: 6645 GeneCards: CCDC25 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
| Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
| Lokacija (UCSC) | Chr 8: 27.73 – 27.77 Mb | Chr 14: 66.07 – 66.1 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Protein sa upredenom zavojnicom–25 (CCDC25) je ljudski protein čija funkcija još uvijek nije jasno određena.
Aminokiselinska sekvenca
[uredi | uredi izvor]Dužina polipeptidnog lanca je 208 aminokiselina, а molekulska težina 24.479 Da.[5]
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MVFYFTSSSV | NSSAYTIYMG | KDKYENEDLI | KHGWPEDIWF | HVDKLSSAHV | ||||
| YLRLHKGENI | EDIPKEVLMD | CAHLVKANSI | QGCKMNNVNV | VYTPWSNLKK | ||||
| TADMDVGQIG | FHRQKDVKIV | TVEKKVNEIL | NRLEKTKVER | FPDLAAEKEC | ||||
| RDREERNEKK | AQIQEMKKRE | KEEMKKKREM | DELRSYSSLM | KVENMSSNQD | ||||
| GNDSDEFM |
Gen
[uredi | uredi izvor]Gen koji kodira protein CCDC25 nalazi se na lokusu 8p21.1, na kratkom kraku hromosoma 8,[6] i transkribira se u proizvod iRNK približne dužine 3.583 nukleotida.
Protein
[uredi | uredi izvor]Opća svojstva
[uredi | uredi izvor]Protein je visoko konzerviran među sisarima kao i eukariotima, tako raznolikim kao što je Arabidopsis thaliana. CCDC25 sastoji se od jednog polipeptidnog lanca dužine 208 aminokiselina i eksprimiran je na visokom nivou, skoro 4,2 puta većem od prosječnog ljudskog proteina.[7] Njegova ekspresija je gotovo sveprisutna u ljudskim tkivima, s malim naznakama da se njegov nivo ekspresije drastično mijenja u oboljelim tkivima.[8] Unatoč tome što još nema dobro razumljivu funkciju, predviđa se da se CCDC25 n alazi u jedru [7] i pokazano je mikromrežnim eksperimentom da se regulira u metafazi II oocita.[9]
Interakcije
[uredi | uredi izvor]CCDC25 je pokazao da stupa u interakciju dvohibridni kvascem, test sa SMAD2, latentnim transkripcijskim faktorom koji je dio TGF-β signalnog puta.[10] Protein je predviđeni supstrat kazein-kinaze 1, kazein-kinaze 2, cGMP zavisne protein-kinaze i insulinskog receptora ; svi oni imaju dobro definirane uloge u ćelijskoj signalizaciji.
Reference
[uredi | uredi izvor]- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000147419 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022035 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "UniProt, Q86WR0". Pristupljeno 15. 9. 2021.
- ^ "Gene - CCDC25".
- ^ a b "AceView - CCDC25".
- ^ "EST Profile - CCDC25".
- ^ "GEO Profiles - GDS3256 CCDC25".
- ^ "MINT - CCDC25".
Dopunska literatura
[uredi | uredi izvor]- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). "Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks". Cell. 127 (3): 635–48. doi:10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
- Rose JE, Behm FM, Drgon T, et al. (2010). "Personalized smoking cessation: interactions between nicotine dose, dependence and quit-success genotype score". Mol. Med. 16 (7–8): 247–53. doi:10.2119/molmed.2009.00159. PMC 2896464. PMID 20379614.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
- Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA, et al. (2004). "Phosphoproteomic analysis of the developing mouse brain". Mol. Cell. Proteomics. 3 (11): 1093–101. doi:10.1074/mcp.M400085-MCP200. PMID 15345747.
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). "Diversification of transcriptional modulation: large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes". Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Vanjski linkovi
[uredi | uredi izvor]Text is available under the CC BY-SA 4.0 license; additional terms may apply.
Images, videos and audio are available under their respective licenses.
