质量加权坐标是描述分子内部运动的一套坐标体系

假设一个分子或离子是由N个原子组成的，每一个原子都有自己的一个平衡位置坐标，当各个原子进行分子内部运动时就会偏离各自的平衡位置，则每个原子会产生相互正交的三个方向上的位移： ${\displaystyle \Delta X_{i))$、${\displaystyle \Delta Y_{i))$和${\displaystyle \Delta Z_{i))$

那么由于这种分子内部运动所引起的动能为：

${\displaystyle T=\sum _{i=1}^{N}\left\((\frac {1}{2))m_{i}\left[\left({\frac {dX_{i)){dt))\right)^{2}+\left({\frac {dY_{i)){dt))\right)^{2}+\left({\frac {dZ_{i)){dt))\right)^{2}\right]\right\))$

如果把质量和位移结合并用统一的符号表示三个正交的坐标：

${\displaystyle q_{i}=\left\((\sqrt {m_{i))}\Delta X_{i};{\sqrt {m_{i))}\Delta Y_{i};{\sqrt {m_{i))}\Delta Z_{i}\right\))$

这个${\displaystyle q_{i))$就是质量加权坐标。

• 用来表示分子内部运动的动能

${\displaystyle T={\frac {1}{2))\sum _{i=1}^{3N}\left({\frac {dq_{i)){dt))\right)^{2))$

• 用来表示分子内部势能

${\displaystyle V={\frac {1}{2))\sum _{i,j}f_{ij}q_{i}q_{j))$

其中${\displaystyle f_{ij))$称为力常数，表达式为：

${\displaystyle f_{ij}={\frac {\partial V}{\partial q_{i}\partial q_{j))))$

• 计算化学
• 分子力学
• 简正坐标