别府车站可能意指下列日本铁路车站：

• 别府车站 (大分县)：位于大分县别府市，为九州旅客铁道（JR九州）日丰本线的车站。
• 别府车站 (兵库县)：位于兵库县加古川市，为山阳电气铁道山阳电气铁道本线的车站。
• 别府车站 (福冈县)：位于福冈县福冈市城南区，为福冈市营地下铁七隈线的车站。
• 东多久车站：位于佐贺县多久市，为九州旅客铁道（JR九州）唐津线的车站；车站在1903年开始营运时名为“别府车站”，1911年更名为“东多久车站”。

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