NTRK2

NTRK2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4AT5, 1HCF, 1WWB, 2MFQ, 4ASZ, 4AT3, 4AT4
Ідентифікатори
Символи	NTRK2, GP145-TrkB, TRKB, trk-B, neurotrophic receptor tyrosine kinase 2, OBHD, EIEE58
Зовнішні ІД	OMIM: 600456 MGI: 97384 HomoloGene: 4504 GeneCards: NTRK2
Пов'язані генетичні захворювання
	obesity, Hyperphagia, and developmental delay
Реагує на сполуку
	entrectinib, altiratinib
Онтологія гена
Молекулярна функція	• neurotrophin binding; • neurotrophin receptor activity; • kinase activity; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity; • ATP binding; • protein kinase activity; • brain-derived neurotrophic factor binding; • transferase activity; • protein homodimerization activity; • protein tyrosine kinase activity; • nucleotide binding; • brain-derived neurotrophic factor-activated receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • receptor tyrosine kinase; • transmembrane signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • ендосома; • postsynaptic membrane; • мембрана; • terminal bouton; • integral component of membrane; • receptor complex; • endosome membrane; • integral component of plasma membrane; • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення; • early endosome; • early endosome membrane; • клітинна мембрана; • аксон; • дендрит (нейробіологія); • perinuclear region of cytoplasm; • цитоплазма; • cell projection; • dendritic spine; • axon terminus; • Golgi membrane;
Біологічний процес	• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process; • peripheral nervous system neuron development; • positive regulation of protein phosphorylation; • oligodendrocyte differentiation; • навчення; • positive regulation of axonogenesis; • васкулогенез; • protein phosphorylation; • central nervous system neuron development; • neuromuscular junction development; • retinal rod cell development; • циркадний ритм; • харчова поведінка; • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity; • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation; • brain-derived neurotrophic factor receptor signaling pathway; • regulation of protein kinase B signaling; • regulation of metabolic process; • positive regulation of MAPK cascade; • диференціація клітин; • фосфорилювання; • neuron migration; • mechanoreceptor differentiation; • нейробіологія розвитку; • glutamate secretion; • retina development in camera-type eye; • neuron differentiation; • cerebral cortex development; • negative regulation of anoikis; • multicellular organism development; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • positive regulation of cell population proliferation; • positive regulation of neuron projection development; • cellular response to amino acid stimulus; • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling; • peptidyl-tyrosine phosphorylation; • довготривала потенціація; • positive regulation of synapse assembly; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; • protein autophosphorylation; • trans-synaptic signaling by neuropeptide, modulating synaptic transmission; • activation of phospholipase C activity; • neurotrophin TRK receptor signaling pathway; • positive regulation of non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity; • trans-synaptic signaling by BDNF, modulating synaptic transmission; • negative regulation of signal transduction; • neuronal action potential propagation; • myelination in peripheral nervous system; • negative regulation of apoptotic process; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • cellular response to nerve growth factor stimulus; • regulation of MAPK cascade; • cellular response to brain-derived neurotrophic factor stimulus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	4915
	18212
	ENSG00000148053
	ENSMUSG00000055254
	Q16620
	P15209
NM_001007097; NM_001018064; NM_001018065; NM_001018066; NM_001291937;
	NM_006180
	NM_001025074; NM_008745; NM_001282961
NP_001007098; NP_001018074; NP_001018075; NP_001018076; NP_001278866;
	NP_006171; NP_001356461; NP_001356462; NP_001356463; NP_001356464; NP_001356465; NP_001356466; NP_001356467; NP_001356468; NP_001356469; NP_001356470; NP_001356471; NP_001356472; NP_001356473; NP_001356474; NP_001356475; NP_001356476; NP_001356477; NP_001356478; NP_001356479; NP_001356480; NP_001356481
	NP_001020245; NP_001269890; NP_032771
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NTRK2 (англ. Neurotrophic receptor tyrosine kinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 822 амінокислот, а молекулярна маса — 91 999^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSWIRWHGP	AMARLWGFCW	LVVGFWRAAF	ACPTSCKCSA	SRIWCSDPSP
GIVAFPRLEP	NSVDPENITE	IFIANQKRLE	IINEDDVEAY	VGLRNLTIVD
SGLKFVAHKA	FLKNSNLQHI	NFTRNKLTSL	SRKHFRHLDL	SELILVGNPF
TCSCDIMWIK	TLQEAKSSPD	TQDLYCLNES	SKNIPLANLQ	IPNCGLPSAN
LAAPNLTVEE	GKSITLSCSV	AGDPVPNMYW	DVGNLVSKHM	NETSHTQGSL
RITNISSDDS	GKQISCVAEN	LVGEDQDSVN	LTVHFAPTIT	FLESPTSDHH
WCIPFTVKGN	PKPALQWFYN	GAILNESKYI	CTKIHVTNHT	EYHGCLQLDN
PTHMNNGDYT	LIAKNEYGKD	EKQISAHFMG	WPGIDDGANP	NYPDVIYEDY
GTAANDIGDT	TNRSNEIPST	DVTDKTGREH	LSVYAVVVIA	SVVGFCLLVM
LFLLKLARHS	KFGMKGPASV	ISNDDDSASP	LHHISNGSNT	PSSSEGGPDA
VIIGMTKIPV	IENPQYFGIT	NSQLKPDTFV	QHIKRHNIVL	KRELGEGAFG
KVFLAECYNL	CPEQDKILVA	VKTLKDASDN	ARKDFHREAE	LLTNLQHEHI
VKFYGVCVEG	DPLIMVFEYM	KHGDLNKFLR	AHGPDAVLMA	EGNPPTELTQ
SQMLHIAQQI	AAGMVYLASQ	HFVHRDLATR	NCLVGENLLV	KIGDFGMSRD
VYSTDYYRVG	GHTMLPIRWM	PPESIMYRKF	TTESDVWSLG	VVLWEIFTYG
KQPWYQLSNN	EVIECITQGR	VLQRPRTCPQ	EVYELMLGCW	QREPHMRKNI
KGIHTLLQNL	AKASPVYLDI	LG

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, білків розвитку, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендосомах.

Література

Stoilov P., Castren E., Stamm S. (2002). Analysis of the human TrkB gene genomic organization reveals novel TrkB isoforms, unusual gene length, and splicing mechanism. Biochem. Biophys. Res. Commun. 290: 1054—1065. PMID 11798182 DOI:10.1006/bbrc.2001.6301
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Meakin S.O., MacDonald J.I.S., Gryz E.A., Kubu C.J., Verdi J.M. (1999). The signaling adapter FRS-2 competes with Shc for binding to the nerve growth factor receptor TrkA. A model for discriminating proliferation and differentiation. J. Biol. Chem. 274: 9861—9870. PMID 10092678 DOI:10.1074/jbc.274.14.9861
Luberg K., Wong J., Weickert C.S., Timmusk T. (2010). Human TrkB gene: novel alternative transcripts, protein isoforms and expression pattern in the prefrontal cerebral cortex during postnatal development. J. Neurochem. 113: 952—964. PMID 20193039 DOI:10.1111/j.1471-4159.2010.06662.x

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з NTRK2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8032 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.((cite web)): Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q16620 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.

Категорії

[1] Захворювання, генетично пов'язані з NTRK2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з neurotrophic receptor tyrosine kinase 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8032 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.((cite web)): Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-6] UniProt, Q16620 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

NTRK2

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.

Література

Примітки

Див. також

Suggest as cover photo

Thank you for helping!

Install Wikiwand

Don't forget to rate us

Tell your friends about Wikiwand!

Enjoying Wikiwand?

Tell your friends and spread the love:

Your preferred languages

All languages

Follow Us

Don't forget to rate us

Our magic isn't perfect

Thank you for helping!

Oh no, there's been an error