COL9A1
Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
COL9A1 (англ. Collagen type IX alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 921 амінокислот, а молекулярна маса — 91 869[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MKTCWKIPVF | FFVCSFLEPW | ASAAVKRRPR | FPVNSNSNGG | NELCPKIRIG | ||||
| QDDLPGFDLI | SQFQVDKAAS | RRAIQRVVGS | ATLQVAYKLG | NNVDFRIPTR | ||||
| NLYPSGLPEE | YSFLTTFRMT | GSTLKKNWNI | WQIQDSSGKE | QVGIKINGQT | ||||
| QSVVFSYKGL | DGSLQTAAFS | NLSSLFDSQW | HKIMIGVERS | SATLFVDCNR | ||||
| IESLPIKPRG | PIDIDGFAVL | GKLADNPQVS | VPFELQWMLI | HCDPLRPRRE | ||||
| TCHELPARIT | PSQTTDERGP | PGEQGPPGPP | GPPGVPGIDG | IDGDRGPKGP | ||||
| PGPPGPAGEP | GKPGAPGKPG | TPGADGLTGP | DGSPGSIGSK | GQKGEPGVPG | ||||
| SRGFPGRGIP | GPPGPPGTAG | LPGELGRVGP | VGDPGRRGPP | GPPGPPGPRG | ||||
| TIGFHDGDPL | CPNACPPGRS | GYPGLPGMRG | HKGAKGEIGE | PGRQGHKGEE | ||||
| GDQGELGEVG | AQGPPGAQGL | RGITGIVGDK | GEKGARGLDG | EPGPQGLPGA | ||||
| PGDQGQRGPP | GEAGPKGDRG | AEGARGIPGL | PGPKGDTGLP | GVDGRDGIPG | ||||
| MPGTKGEPGK | PGPPGDAGLQ | GLPGVPGIPG | AKGVAGEKGS | TGAPGKPGQM | ||||
| GNSGKPGQQG | PPGEVGPRGP | QGLPGSRGEL | GPVGSPGLPG | KLGSLGSPGL | ||||
| PGLPGPPGLP | GMKGDRGVVG | EPGPKGEQGA | SGEEGEAGER | GELGDIGLPG | ||||
| PKGSAGNPGE | PGLRGPEGSR | GLPGVEGPRG | PPGPRGVQGE | QGATGLPGVQ | ||||
| GPPGRAPTDQ | HIKQVCMRVI | QEHFAEMAAS | LKRPDSGATG | LPGRPGPPGP | ||||
| PGPPGENGFP | GQMGIRGLPG | IKGPPGALGL | RGPKGDLGEK | GERGPPGRGP | ||||
| NGLPGAIGLP | GDPGPASYGR | NGRDGERGPP | GVAGIPGVPG | PPGPPGLPGF | ||||
| CEPASCTMQA | GQRAFNKGPD | P |
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
- Muragaki Y., Kimura T., Ninomiya Y., Olsen B.R. (1990). The complete primary structure of two distinct forms of human alpha 1 (IX) collagen chains. Eur. J. Biochem. 192: 703—708. PMID 2209617 DOI:10.1111/j.1432-1033.1990.tb19279.x
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Diab M., Wu J.J., Eyre D.R. (1996). Collagen type IX from human cartilage: a structural profile of intermolecular cross-linking sites. Biochem. J. 314: 327—332. PMID 8660302 DOI:10.1042/bj3140327
- Muragaki Y., Nishimura I., Henney A., Ninomiya Y., Olsen B.R. (1990). The alpha 1 (IX) collagen gene gives rise to two different transcripts in both mouse embryonic and human fetal RNA. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 2400—2404. PMID 1690886 DOI:10.1073/pnas.87.7.2400
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2217 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P20849 (англ.) . Архів оригіналу за 27 листопада 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
| Позаклітинний матрикс |
| ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Інші | |||||||||||||
|
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Text is available under the CC BY-SA 4.0 license; additional terms may apply.
Images, videos and audio are available under their respective licenses.
Cover photo is available under {{::mainImage.info.license.name || 'Unknown'}} license.
Cover photo is available under {{::mainImage.info.license.name || 'Unknown'}} license.
Credit:
(see original file).
