Otto Stern (d. 17 Şubat 1888 - ö. 17 Ağustos 1969) Alman fizikçi.

Alman İmparatorluğuna ait Prusya Krallığı sınırlarındaki Sorau (Żary) de doğmuştur (şu an Polonya topraklarında). Eğitimini University of Breslau 'da tamamlamış ve fiziksel kimya dalında doktora yapmıştır. Rostock Üniversitesinde profesör olarak çalışmıştır. 1923 yılında Institut für Physikalische Chemie adlı yeni bir bölümde çalışmak üzere Hamburg Üniversitesinde geçmiştir.

Nazi dönemi nedeniyle Carnegie Institute of Technology e geçmiş ve akabinde University of California, Berkeley de çalışmalarına devam etmiştir.

Stern deneysel fizikçiydi. Molecular Ray Method un geliştirilmesi için çalışmıştır. Atomik manyetik hareket ölçümleri, atom ve moleküllerin doğal hareketlerinin demonstre edilmesi, protonun manyetik hareketinin keşfi diğer çalışma konularıydı. Bundan dolayı 1943 yılında Nobel Fizik Ödülü'ne layık görülmüştür.