For faster navigation, this Iframe is preloading the Wikiwand page for BioBrick.

BioBrick

Материал из Википедии — свободной энциклопедии

Стандартные визуальные символы для языка Synthetic Biology Open Language (SBOL) используемого в стандарте BioBricks

BioBrick (БиоБлок) — последовательности ДНК, предназначенные для сборки рестриктазно-лигазным методом, которые используются для разработки и создания искусственных биологических систем с определенными свойствами[1][2]. C 2008 года признается ведущим стандартом синтетической биологии[2]. После разработки на компьютере, код, как правило, внедряют в живые клетки, например Escherichia coli, чтобы придать им новые функции.

Снизу вверх: часть, устройство, система

Иерархия стандарта

[править | править код]

Стандарт имеет трехуровневую иерархическую систему, на которой основана cинтетическая биология:

  1. Части: последовательность ДНК, которая формирует функциональную единицу (например промоторы, сайты связывания рибосом, кодирующие последовательности, терминаторные последовательности и пр.)
  2. Устройства: набор соединённых воедино взаимодополняющих частей, обладающий заданной функцией;
  3. Системы: набор устройств, выполняющих высокоуровневые задачи;

Преимущества стандарта

[править | править код]

Стандарт разработан в MIT с целью применения инженерных принципов абстракции и модульности в области программирования биологических систем и живых организмов. Преимущества стандартизированного подхода Biobrick:

  • высокая скорость сборки последовательностей;
  • надежность высокоуровневых систем увеличивается за счет возможности независимо тестировать и классифицировать отдельные, более низкоуровневые, части и устройства;
  • потенциал большего охвата участников (ученых и специалистов) по сравнению с классическими подходами;

История BioBrick

[править | править код]

Стандарт BioBrick был описан и представлен Томом Найтом в MIT. С этого момента различные исследовательские группы начали использовать BioBrick для создания новых биологических устройств и систем.

В 2006 году инженерами и учеными была основана некоммерческая организация BioBricks Foundation с целью стандартизировать биологические части в данной области науки.[3]

С начала проекта уже более 2000 элементов BioBrick были выложены в открытый доступ и доступны в Реестре Стандартных биологических частей. BioBrick признается ведущим стандартом синтетической биологии[2]

В соревнованиях iGEM 2015 приняло участие 5018 участников (280 команд) из 38 стран [1]

В соревнованиях iGEM 2017 приняло участие 5400 участников (310 команд).

В Каталоге частей BioBrick было уже более 20000 задокументированных генетических частей. Данные части доступны для свободного использования командам iGEM и академическим лабораториям [2].

Альтернативные стандарты

[править | править код]

Первая попытка создать список стандартизированных биологических частей NOMAD была предпринята в 1996 году группой учёных под руководством Д. Ребатчука. Его команда представили стратегию клонирования для сборки коротких фрагментов ДНК. Но эта ранняя попытка не получила широкого распространения.[4]

Смотреть также

[править | править код]

Примечания

[править | править код]
  1. Tom Knight (2003). Idempotent Vector Design for Standard Assembly of Biobricks. Дата обращения: 26 сентября 2014. Архивировано 6 октября 2014 года.
  2. 1 2 3 Knight, Thomas F; Reshma P Shetty; Drew Endy. Engineering BioBrick vectors from BioBrick parts (неопр.) // Journal of Biological Engineering. — 2008. — 14 April (т. 2, № 5). — С. 1—12. — doi:10.1186/1754-1611-2-5. — PMID 18410688. — PMC 2373286. Архивировано 28 сентября 2015 года.
  3. BioBricks Foundation. BioBricks Foundation. Дата обращения: 19 марта 2018. Архивировано 12 марта 2018 года.
  4. Rebatchouk, Dmitri; Daraselia, N.; Narita, J. O. NOMAD: a versatile strategy for in vitro DNA manipulation applied to promoter analysis and vector design. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — 1 October (vol. 93, no. 20). — P. 10891—10896. — doi:10.1073/pnas.93.20.10891. Архивировано 24 сентября 2015 года.
{{bottomLinkPreText}} {{bottomLinkText}}
BioBrick
Listen to this article

This browser is not supported by Wikiwand :(
Wikiwand requires a browser with modern capabilities in order to provide you with the best reading experience.
Please download and use one of the following browsers:

This article was just edited, click to reload
This article has been deleted on Wikipedia (Why?)

Back to homepage

Please click Add in the dialog above
Please click Allow in the top-left corner,
then click Install Now in the dialog
Please click Open in the download dialog,
then click Install
Please click the "Downloads" icon in the Safari toolbar, open the first download in the list,
then click Install
{{::$root.activation.text}}

Install Wikiwand

Install on Chrome Install on Firefox
Don't forget to rate us

Tell your friends about Wikiwand!

Gmail Facebook Twitter Link

Enjoying Wikiwand?

Tell your friends and spread the love:
Share on Gmail Share on Facebook Share on Twitter Share on Buffer

Our magic isn't perfect

You can help our automatic cover photo selection by reporting an unsuitable photo.

This photo is visually disturbing This photo is not a good choice

Thank you for helping!


Your input will affect cover photo selection, along with input from other users.

X

Get ready for Wikiwand 2.0 🎉! the new version arrives on September 1st! Don't want to wait?