Бакте́рии (эубактерии, лат. Eubacteria, от др.-греч. βακτήριον — палочка) — домен (надцарство) прокариотных (безъядерных) микроорганизмов, чаще всего одноклеточных. К настоящему времени описано около десяти тысяч видов бактерий и предполагается, что их существует свыше миллиона.

• Класс Aquificae
  • Порядок Aquificales
    • Семейство Aquificaceae
      • Роды Aquifex, Calderobacterium, Hydrogenobaculum, Hydrogenobacter, Hydrogenothermus, Persephonella, Sulfurihydrogenibium, Thermocrinis
    • Роды incertae sedis Desulfurobacterium, Thermovibrio

• Класс Thermotogae
  • Порядок Thermotogales
    • Семейство Thermotogaceae
      • Роды Thermotoga, Fervidobacterium, Geotoga, Marinitoga, Petrotoga, Thermosipho

• Класс Thermodesulfobacteria
  • Порядок Thermodesulfobacteriales
    • Семейство Thermodesulfobacteriaceae
      • Род Thermodesulfobacterium

• Класс Deinococci
  • Порядок Deinococcales
    • Семейство Deinococcaceae
      • Род Deinococcus
  • Порядок Thermales
    • Семейство Thermaceae
      • Роды Thermus, Marinithermus, Meiothermus, Oceaniothermus, Vulcanithermus

• Класс Chrysiogenetes
  • Порядок Chrysiogenales
    • Семейство Chrysiogenaceae
      • Род Chrysiogenes

• Класс «Chloroflexi»
  • Порядок «Chloroflexales»
    • Семейство «Chloroflexaceae»
      • Роды Chloroflexus, Chloronema, Heliothrix, Roseiflexus
    • Семейство Oscillochloriaceae
      • Род Oscillochloris
  • Порядок Herpetosiphonales
    • Семейство Herpetosiphonaceae
      • Род Herpetosiphon
• Класс Anaerolinae
  • Порядок Anaerolinales
    • Семейство Anaerolinaceae

• Класс Thermomicrobia
  • Порядок Thermomicrobiales
    • Семейство Thermomicrobiaceae
      • Род Thermomicrobium

• Класс Nitrospira
  • Порядок Nitrospirales
    • Семейство Nitrospiraceae
      • Роды Nitrospira, Leptospirillum, Magnetobacterium, Thermodesulfovibrio

• Класс Deferribacteres
  • Порядок Deferribacterales
    • Семейство Deferribacteraceae
      • Роды Deferribacteres, Denitrovibrio, Flexistipes, Geovibrio

• Класс Cyanobacteria

• Класс Chlorobia
  • Порядок Chlorobiales
    • Семейство Chlorobiaceae
      • Роды Chlorobium, Ancalochloris, Chlorobalum, Chloroherpeton, Pelodictyon, Prosthecochloris

• Класс Alphaproteobacteria
  • Порядок Rhodospirillales
    • Семейство Rhodospirillaceae
      • Роды Rhodospirillum, Azospirillum, Levispirillum, Magnetospirillum, Phaeospirillum, Rhodocista, Rhodospira, Rhodovibrio, Roseospira, Roseospirillum, Skermanella
      • Род incertae sedis «Sporospirillum»
    • Семейство Acetobacteraceae
      • Роды Acetobacter, Acidiphilium, Acidisphaera, Acidocella, Acidomonas, Asaia, Craurococcus, Gluconacetobacter, Gluconobacter, Paracraurococcus, Rhodopila, Roseococcus, Roseomonas, Stella, Zavarzinia
  • Порядок Rickettsiales
    • Семейство Rickettsiaceae
      • Роды Rickettsia, Orientia
    • Семейство Anaplasmataceae
      • Роды Anaplasma, Ehrlichia, Neorickettsia, Wolbachia
    • Род incertae sedis Aegyptianella
    • Семейство Holosporaceae
      • Род Holospora
    • Роды incertae sedis Caedibacter, Lyticum, Odyssella, Pseudocaedibacter, Pseudolyticum, Tectibacter
  • Порядок Rhodobacterales
    • Семейство Rhodobacteraceae
      • Роды Rhodobacter, Ahrensia, Amaricoccus, Antarctobacter, Gemmobacter, Hirschia, Hyphomonas, Ketogulonicigenium, Maricaulis, Methylarcula, Octadecabacter, Paracoccus, Rhodobaca, Rhodovulum, Roseibium, Roseinatronobacter, Roseivivax, Roseobacter, Roseovarius, Rubrimonas, Ruegeria, Sagittula, Staleya, Stappia, Sulfitobacter
    • Род incertae sedis Rhodothalassium
  • Порядок Sphingomonadales
    • Семейство Sphingomonadaceae
      • Роды Sphingomonas, Blastomonas, Citromicrobium, Erythrobacter, Erythromicrobium, Erythromonas, Porphyrobacter, Sandaracinobacter, Zymomonas
  • Порядок Caulobacterales
    • Семейство Caulobacteraceae
      • Роды Caulobacter, Asticcacaulis, Brevundimonas, Phenylobacterium
  • Порядок Rhizobiales
    • Семейство Rhizobiaceae
      • Роды Rhizobium, Agrobacterium, Allorhizobium, Carbophilus, Chelatobacter, Ensifer, Sinorhizobium
    • Семейство Bartonellaceae
      • Род Bartonella
    • Семейство Brucellaceae
      • Роды Brucella, Mycoplana, Ochrobactrum
    • Семейство Phyllobacteriaceae
      • Роды Phyllobacterium, Aminobacter, Aquamicrobium, Defluvibacter, Liberibacter, Mesorhizobiumm, Pseudominobacter
    • Семейство Methylocystaceae
      • Роды Methylocystis, Albibacter, Methylosinus
    • Род incertae sedis Methylopila
    • Семейство Beijerinckiaceae
      • Роды Beijerinckia, Chelatococcus, Methylocella
    • Семейство Bradyrhizobiaceae
      • Роды Bradyrhizobium, Afipia, Agromonas, Blastobacter, Bosea, Nitrobacter, Oligotropha, Rhodoblastus, Rhodopseudomonas
    • Семейство Hyphomicrobiaceae
      • Роды Hyphomicrobium, Ancalomicrobium, Ancylobacter, Angulomicrobium, Aquabacter, Azorhizobium, Blastochloris, Devosia, Dichotomicrobium, Filomicrobium, Gemmiger, Labrys, Methylorhabdus, Pedomicrobium, Prosthecomicrobium, Rhodomicrobium, Rhodoplanes, Seliberia, Starkeya, Xanthobacter
    • Семейство Methylobacteriaceae
      • Род Methylobacterium
    • Семейство Rhodobiaceae
      • Род Rhodobium

• Класс Betaproteobacteria
  • Порядок Burkholderiales
    • Семейство Burkholderiaceae
      • Роды Burkholderia, Cupriavidus, Lautropia, Pandoraea, Paucimonas, Polynucleobacter, Ralstonia, Thermothrix
    • Семейство Oxalobacteraceae
      • Роды Oxalobacter, Duganella, Herbaspirillum, Janthinobacterium, Massilia, Telluria
    • Семейство Alcaligenaceae
      • Роды Alcaligenes, Achromobacter, Bordetella, Derxia, Oligella, Pelistega, Pigmentiphaga, Sutterella, Taylorella
    • Семейство Comamonadaceae
      • Роды Comamonas, Acidovorax, Brachymonas, Delftia, Hydrogenophaga, Lampropedia, Macromonas, Polaromonas, Rhodoferax, Variovorax
    • Роды incertae sedis Aquabacterium, Ideonella, Leptothrix, Roseateles, Rubrivivax, Sphaerotilus, Tepidimonas, Thiomonas, Xylophilus
  • Порядок Hydrogenophilales
    • Семейство Hydrogenophilaceae
      • Роды Hydrogenophilus, Thiobacillus
  • Порядок Methylophilales
    • Семейство Methylophilaceae
      • Роды Methylophilus, Methylobacillus, Methylovorus
  • Порядок Neisseriales
    • Семейство Neisseriaceae
      • Роды Neisseria, Alysiella, Aquaspirillum, Chromobacterium, Eikenella, Formivibrio, Iodobacter, Kingella, Microvirgula, Prolinoborus, Simonsiella, Vitreoscilla, Vogesella
    • Роды incertae sedis Catenococcus, Morococcus
  • Порядок Nitrosomonadales
    • Семейство Nitrosomonadaceae
      • Роды Nitrosomonas, Nitrosolobus, Nitrosospira, Nitrosovibrio
    • Семейство Spirillaceae
      • Род Spirillum
    • Семейство Gallionellaceae
      • Род Gallionella
  • Порядок Rhodocyclales
    • Семейство Rhodocyclaceae
      • Роды Rhodocyclus, Azoarcus, Azonexus, Azospira, Azovibrio, Dechloromonas, Dechlorosoma, Ferribacterium, Propionibacter, Propionivibrio, Thauera, Zoogloea

• Класс Gammaproteobacteria
  • Порядок Chromatiales
    • Семейство Chromatiaceae
      • Роды Chromatium, Allochromatium, Halochromatium, Isochromatium, Lamprobacter, Lamprocystis, Marichromatium, Nitrosococcus, Pfennigia, Rhabdochromatium, Thermochromatium, Thioalkalicoccus, Thiocapsa, Thiococcus, Thiocystis, Thiodictyon, Thiohalocapsa, Thiolamprovum, Thiopedia, Thiorhodococcus, Thiorhodovibrio, Thiospirillum
    • Семейство Ectothiorhodospiraceae
      • Роды Ectothiorhodospira, Arhodomonas, Halorhodospira, Nitrococcus, Thioalkalivibrio, Thiorhodospira
    • Семейство Halothiobacillaceae
      • Род Halothiobacillus
  • Порядок Acidithiobacillales
    • Семейство Acidithiobacillaceae
      • Род Acidithiobacillus
    • Семейство Thermithiobacillaceae
      • Род Thermithiobacillus
  • Порядок Xanthomonadales
    • Семейство Xanthomonadaceae
      • Роды Xanthomonas, Frateuria, Luteimonas, Lysobacter, Nevskia, Pseudoxanthomonas, Rhodanobacter, Schineria, Stenotrophomonas, Thermomonas, Xylella
  • Порядок Cardiobacteriales
    • Семейство Cardiobacteriaceae
      • Роды Cardiobacterium, Dichelobacter, Suttonella
  • Порядок Thiotrichales
    • Семейство Thiotrichaceae
      • Роды Thiothrix, Achromatium, Beggiatoa, Leucothrix, Thiobacterium, Thiomargarita, Thioploca, Thiospira
    • Семейство Piscirickettsiaceae
      • Роды Piscirickettsia, Cycloclasticus, Hydrogenovibrio, Methylophaga, Thioalkalimicrobium, Thiomicrospira
    • Семейство Francisellaceae
      • Род Francisella
  • Порядок Legionellales
    • Семейство Legionellaceae
      • Род Legionella
    • Семейство Coxiellaceae
      • Роды Coxiella, Rickettsiella
  • Порядок Methylococcales
    • Семейство Methylococcaceae
      • Роды Methylococcus, Methylobacter, Methylocaldum, Methylomicrobium, Methylomonas, Methylosarcina, Methylosphaera
  • Порядок Oceanospirillales
    • Семейство Oceanospirillaceae
      • Роды Oceanospirillum, Balneatrix, Marinomonas, Marinospirillum, Neptunomonas
    • Семейство Alcanivoraceae
      • Род Alcanivorax
    • Семейство Hahellaceae
      • Роды Hahella
    • Семейство Halomonadaceae
      • Роды Halomonas, Caminomonas, Chromohalobacter, Zymobacter
  • Порядок Pseudomonadales
    • Семейство Pseudomonadaceae
      • Роды Pseudomonas, Azomonas, Azotobacter, Cellvibrio, Mesopllilobacter, Rhizobacter, Rugamonas, Serpens
    • Семейство Moraxellaceae
      • Роды Moraxella, Acinetobacter, Psychrobacter
    • Род incertae sedis Enhydrobacter
  • Порядок Alteromonadales
    • Семейство Alteromonadaceae
      • Роды Alteromonas, Alishewanella, Colwellia, Ferrimonas, Glaciecola, Idiomarina, Marinobacter, Marinobacterium, Microbulbifer, Moritella, Pseudoalteromonas, Psychromonas, Shewanella
  • Порядок Vibrionales
    • Семейство Vibrionaceae
      • Роды Vibrio, Photobacterium, Salinivibrio
  • Порядок Aeromonadales
    • Семейство Aeromonadaceae
      • Роды Aeromonas, Oceanimonas
    • Род incertae sedis Tolumonas
    • Семейство Succinivibrionaceae
      • Роды Succinivibrio, Anaerobiospirillum, Ruminobacter, Succinimonas
  • Порядок Enterobacteriales
    • Семейство Enterobacteriaceae
      • Роды Escherichia, Alterococcus, Arsenophonus, Brenneria, Buchnera, Budvicia, Buttiauxella, Calymmatobacterium, Cedecea, Citrobacter, Edwardsiella, Enterobacter, Erwinia, Ewingella, Hafnia, Klebsiella, Kluyvera, Leclercia, Leminorella, Moellerella, Morganella, Obesumbacterium, Pantoea, Pectobacterium, Candidatus Phlomobacter, Photorhabdus, Plesiomonas, Pragia, Proteus, Providencia, Ralmella, Saccharobacter, Salmonella, Serratia, Shigella, Sodalis, Tatumella, Trabulsiella, Wigglesworthia, Xenorhabdus, Yersinia, Yokenella
  • Порядок Pasteurellales
    • Семейство Pasteurellaceae
      • Роды Pasteurella, Actinobacillus, Haemophilus, Lonepinella, Mannheimia, Phocoenobacter

• Класс Deltaproteobacteria
  • Порядок Desulfurellales
    • Семейство Desulfurellaceae
      • Роды Desulfurella, Hippea
  • Порядок Desulfovibrionales
    • Семейство Desulfovibrionaceae
      • Роды Desulfovibrio, Bilophila, Lawsonia
    • Семейство Desulfomicrobiaceae
      • Род Desulfomicrobium
    • Семейство Desulfohalobiaceae
      • Роды Desulfohalobium, Desulfonatronovibrio, Desulfothermus
    • Семейство Desulfonatronumaceae
      • Род Desulfonatronum
  • Порядок Desulfobacterales
    • Семейство Desulfobacteraceae
      • Роды Desulfobacter, Desulfobacterium, Desulfobacula, Desulfobotulus, Desulfocella, Desulfococcus, Desulfofaba, Desulfofrigus, Desulfonema, Desulfosarcina, Desulfospira, Desulfotignum
    • Семейство Desulfobulbaceae
      • Роды Desulfobulbus, Desulfocapsa, Desulfofustis, Desulforhopalus, Desulfotalea
    • Семейство Nitrospinaceae
      • Род Nitrospina
  • Порядок Desulfarcales
    • Семейство Desulfarculaceae
      • Род Desulfarculus
  • Порядок Desulfuromonales
    • Семейство Desulfuromonaceae
      • Роды Desulfuromonas, Desulfuromusa, Malonomonas, Pelobacter
    • Семейство Geobacteraceae
      • Роды Geobacter, Trichlorobacter
  • Порядок Syntrophobacterales
    • Семейство Syntrophobacteraceae
      • Роды Syntrophobacter, Desulfacinum, Desulforhabdus, Desulfovirga, Thermodesulforhabdus
    • Семейство Syntrophaceae
      • Роды Syntrophus, Desulfobacca, Desulfomonile, Smithella
  • Порядок Bdellovibrionales
    • Семейство Bdellovibrionaceae
      • Роды Bdellovibrio, Bacteriovorax, Micavibrio, Vampirovibrio
  • Порядок Myxococcales
    • Семейство Myxococcaceae
      • Роды Myxococcus, Corallococcus, Pyxicoccus, Chondromyces
    • Семейство Cystobacteraceae
      • Роды Cystobacter, Archangium, Hyalangium, Melittangium, Stigmatella
    • Семейство Polyangiaceae
      • Роды Polyangium, Byssophaga, Haploangium, Jahmia, Sorangium
    • Семейство Nannocystaceae
      • Род Nannocystis
    • Семейство Kofleriaceae
      • Род Kofleria

• Класс Epsilonproteobacteria
  • Порядок Campylobacterales
    • Семейство Campylobacteraceae
      • Роды Campylobacter, Arcobacter, Sulfurospirillum
    • Семейство Helicobacteraceae
      • Роды Helicobacter, Thiovulum, Wolinella

• Класс Bacilli
  • Порядок Bacillales
    • Семейство Alicyclobacillaceae
      • Роды Alicyclobacillus, Pasteuria, Sulfobacillus
    • Семейство Bacillaceae
      • Роды Alkalibacillus, Amphibacillus, Anoxybacillus, Bacillus, Caldalkalibacillus, Cerasibacillus, Exiguobacterium, Filobacillus, Geobacillus, Gracilibacillus, Halalkalibacillus, Halobacillus, Halolactibacillus, Jeotgalibacillus, Lentibacillus, Lysinibacillus, Marinibacillus, Oceanobacillus, Ornithinibacillus, Paraliobacillus, Paucisalibacillus, Pelagibacillus, Piscibacillus, Pontibacillus, Saccharococcus, Salibacillus, Salimicrobium, Salinibacillus, Salirhabdus, Salsuginibacillus, Tenuibacillus, Terribacillus, Thalassobacillus, Ureibacillus, Virgibacillus, Vulcanibacillus
    • Семейство Caryophanaceae
      • Род Caryophanon
    • Семейство Listeriaceae
      • Роды Brochothrix, Listeria
    • Семейство Paenibacillaceae
      • Роды Paenibacillus, Ammoniphilus, Aneurinibacillus, Brevibacillus, Oxalophagus, Thermicanus, Thermobacillus
    • Семейство Planococcaceae
      • Роды Filibacter, Kurthia, Planomicrobium, Sporosarcina
    • Семейство Sporolactobacillaceae
      • Роды Sporolactobacillus, Marinococcus
    • Семейство Staphylococcaceae
      • Роды Staphylococcus, Gemella, Jeotgalicoccus, Macrococcus, Salinicoccus
    • Семейство Thermoactinomycetaceae
      • Род Thermoactinomyces
    • Семейство Turicibacteraceae
      • Род Turicibacter
  • Порядок Lactobacillales
    • Семейство Aerococcaceae
      • Род Aerococcus
    • Семейство Carnobacteriaceae
      • Род Carnobacterium
    • Семейство Enterococcaceae
      • Роды Atopobacter, Enterococcus, Melissococcus, Tetragenococcus, Vagococcus
    • Семейство Lactobacillaceae
      • Роды Lactobacillus, Paralactobacillus, Pediococcus
    • Семейство Leuconostocaceae
      • Роды Leuconostoc, Oenococcus, Weissella
    • Семейство Streptococcaceae
      • Роды Lactococcus, Lactovum, Pilibacter, Streptococcus

• Класс Clostridia
  • Порядок Clostridiales
    • Семейство Acidaminococcaceae
      • Роды Acetonema, Acidaminococcus, Anaeromusa, Dialister, Megasphaera, Pectinatus, Phascolarctobacterium, Quinella, Schwartzia, Selenomonas, Sporomusa, Succinclasticum, Veillonella, Zymophilus
    • Семейство Clostridiaceae
      • Роды Acetanaerobacterium, Acetivibrio, Acidaminobacter, Alkaliphilus, Anaerobacter, Anaerotruncus, Anoxynatronum, Bryantella, Caldanaerocella, Caloramator, Caloranaerobacter, Caminicella, Candidatus Arthromitus, Clostridium, Coprobacillus, Dorea, Ethanologenbacterium, Faecalibacterium, Garciella, Guggenheimella, Hespellia, Linmingia, Natronincola, Oxobacter, Parasporobacterium, Sarcina, Soehngenia, Sporobacter, Subdoligranulum, Tepidibacter, Tepidimicrobium, Thermobrachium, Thermohalobacter, Tindallia
    • Семейство Eubacteriaceae
      • Род Eubacterium
    • Семейство Heliobacteriaceae
      • Роды Heliobacterium, Heliobacillus, Heliophilum, Heliorestis
    • Семейство Lachnospiraceae
      • Род Lachnospira
    • Семейство Peptococcaceae
      • Род Peptococcus
    • Семейство Peptostreptococcaceae
      • Роды Filifactor, Finegoldia, Fusibacter, Helcococcus, Micromonas, Peptostreptococcus, Tissierella
    • Семейство Syntrophomonadaceae
      • Род Syntrophomonas
  • Порядок Halanaerobiales
    • Семейство Halanaerobiaceae
      • Род Halanaerobium
    • Семейство Halobacteroidaceae
      • Род Halobacteroides
  • Порядок Thermoanaerobacteriales
    • Семейство Thermoanaerobacteriaceae
    • Семейство Thermodesulfobiaceae

• Класс Mollicutes
  • Порядок Mycoplasmatales
    • Семейство Mycoplasmataceae
      • Роды Candidatus Hepatoplasma, Mycoplasma, Ureaplasma
  • Порядок Entomoplasmatales
    • Семейство Entomoplasmataceae
      • Роды Entomoplasma, Mesoplasma
    • Семейство Spiroplasmataceae
      • Род Spiroplasma
  • Порядок Anaeroplasmatales
    • Семейство Anaeroplasmataceae
      • Роды Anaeroplasma, Asteroleplasma
    • Семейство Erysipelotrichaceae
      • Роды Erysipelothrix, Holdemania, Solobacterium
  • Порядок Acholeplasmatales
    • Семейство Acholeplasmataceae
      • Роды Acholeplasma, Candidatus Phytoplasma

• Класс Bacteroidia
  • Порядок Bacteroidales
    • Семейство Bacteroidaceae
      • Роды Acetofilamentum, Acetomicrobium, Acetothermus, Anaerorhabdus, Bacteroides
    • Семейство Marinilabiaceae
      • Роды Alkaliflexus, Anaerophaga, Marinilabilia
    • Семейство Porphyromonadaceae
      • Роды Barnesiella, Capsularis, Dysgonomonas, Odoribacter, Oribaculum, Paludibacter, Parabacteroides, Petrimonas, Porphyromonas, Proteiniphilum, Tannerella
    • Семейство Prevotellaceae
      • Роды Hallella, Prevotella, Xylanibacter
    • Семейство Rikenellaceae
      • Роды Alistipes, Rikenella

• Класс Flavobacteria
  • Порядок Flavobacteriales
    • Семейство Blattabacteriaceae
      • Род Blattabacterium
    • Семейство Cryomorphaceae
      • Роды Brumimicrobium, Crocinitomix, Cryomorpha, Fluviicola, Lishizhenia, Owenweeksia, Sediminitomix
    • Семейство Flavobacteriaceae
      • Роды Actibacter, Aequorivita, Algibacter, Aquimarina, Arenibacter, Bergeyella, Bizionia, Capnocytophaga, Cellulophaga, Chryseobacterium, Cloacibacterium, Coenonia, Costertonia, Croceibacter, Dokdonia, Donghaeana, Elizabethkingia, Empedobacter, Epilithonimonas, Flagellimonas, Flaviramulus, Flavobacterium, Formosa, Fulvibacter, Gaetbulibacter, Gaetbulimicrobium, Galbibacter, Gelidibacter, Gillisia, Gilvibacter, Gramella, Joostella, Kaistella, Kordia, Krokinobacter, Lacinutrix, Leeuwenhoekiella, Lutibacter, Lutimonas, Maribacter, Mariniflexile, Marixanthomonas, Mesoflavibacter, Mesonia, Muricauda, Myroides, Nonlabens, Olleya, Ornithobacterium, Persicivirga, Pibocella, Polaribacter, Psychroflexus, Psychroserpens, Riemerella, Robiginitalea, Salinimicrobium, Salegentibacter, Sandarakinotalea, Sediminibacter, Sediminicola, Sejongia, Stanierella, Stenothermobacter, Subsaxibacter, Subsaximicrobium, Tamlana, Tenacibaculum, Ulvibacter, Vitellibacter, Wautersiella, Weeksella, Winogradskyella, Yeosuana, Zeaxanthinibacter, Zhouia, Zobellia, Zunongwangia

• Класс Sphingobacteria
  • Порядок Sphingobacteriales
    • Семейство Chitinophagaceae
      • Роды Balneola, Chitinophaga, Niastella, Terrimonas, Toxothrix
    • Семейство Cyclobacteriaceae
      • Роды Algoriphagus, Aquiflexum, Belliella, Chimaereicella, Cyclobacterium, Echinicola, Hongiella
    • Семейство Cytophagaceae
      • Роды Adhaeribacter, Arcicella, Cytophaga, Dyadobacter, Effluviibacter, Emticicia, Flectobacillus, Flexibacter, Hymenobacter, Larkinella, Leadbetterella, Meniscus, Microscilla, Persicitalea, Pontibacter, Rhodonellum, Rudanella, Runella, Spirosoma, Sporocytophaga
    • Семейство Flammeovirgaceae
      • Роды Fabibacter, Flammeovirga, Flexithrix, Limibacter, Marinicola, Perexilibacter, Persicobacter, Rapidithrix, Reichenbachiella, Roseivirga, Thermonema
    • Семейство Rhodothermaceae
      • Роды Rhodothermus, Salinibacter
    • Семейство Saprospiraceae
      • Роды Aureispira, Haliscomenobacter, Lewinella, Saprospira
    • Семейство Sphingobacteriaceae
      • Роды Mucilaginibacter, Nubsella, Olivibacter, Parapedobacter, Pedobacter, Pseudosphingobacterium, Sphingobacterium
    • Род incertae sedis Niabella

• «Bacteroidetes», Роды incertae sedis Flavisolibacter, Fulvivirga, Prolixibacter, Segetibacter

• Класс Planctomycetia
  • Порядок Planctomycetales
    • Семейство Planctomycetaceae
      • Роды Blastopirellula, Gemmata, Isosphaera, Pirellula, Planctomyces, Rhodopirellula, Schlesneria, Singulisphaera, candidatus Brocadia, candidatus Kuenenia, candidatus Scalindua, candidatus Anammoxoglobus

• Класс Chlamydiae
  • Порядок Chlamydiales
    • Семейство Chlamydiaceae
      • Роды Chlamydia, Chlamydophila
    • Семейство Parachlamydiaceae
      • Роды Neochlamydia, Parachlamydia
    • Семейство Simkaniaceae
      • Род Simkania
    • Семейство Waddliaceae
      • Род Waddlia

• Класс Spirochaetes
  • Порядок Spirochaetales
    • Семейство Brachyspiraceae
      • Роды Brachyspira, Serpulina
    • Семейство Brevinemataceae
      • Род Brevinema
    • Семейство Leptospiraceae
      • Роды Leptonema, Leptospira, Turneriella
    • Семейство Spirochaetaceae
      • Роды Borrelia, Clevelandina, Cristispira, Diplocalyx, Hollandina, Pillotina, Spirochaeta, Treponema

• Класс Fibrobacteria
  • ПорядокFibrobacterales
    • Семейство Fibrobacteraceae
      • Род Fibrobacter

• Класс Fusobacteria
  • Порядок Fusobacteriales
    • Семейство Fusobacteriaceae
      • Роды Cetobacterium, Fusobacterium, Ilyobacter, Propionigenium
    • Семейство Leptotrichiaceae
      • Роды Leptotrichia, Sebaldella, Sneathia, Streptobacillus

• Класс Acidobacteria
  • Порядок Acidobacteriales
    • Семейство Acidobacteriaceae
      • Роды Acidobacterium, Edaphobacter, Geothrix, Holophaga, Terriglobus

• Класс Verrucomicrobiae
  • Порядок Verrucomicrobiales
    • Семейство Akkermansiaceae
      • Род Akkermansia
    • Семейство Rubritaleaceae
      • Род Rubritalea
    • Семейство Verrucomicrobiaceae
      • Роды Luteolibacter, Persicirhabdus, Prosthecobacter, Roseibacillus, Verrucomicrobium
• Класс Opitutae
  • Порядок Opitutales
    • Семейство Opitutaceae
      • Роды Alterococcus, Opitutus
  • Порядок Puniceicoccales
    • Семейство Puniceicoccaceae
      • Роды Cerasicoccus, Coraliomargarita, Pelagicoccus, Puniceicoccus

• Класс Dictyoglomia
  • Порядок Dictyoglomales
    • Семейство Dictyoglomaceae
      • Род Dictyoglomus

• Класс Gemmatimonadetes
  • Порядок Gemmatimonadales
    • Семейство Gemmatimonadaceae
      • Род Gemmatimonas

• Класс Actinobacteria
  • Порядок Acidimicrobiales
    • Семейство Acidimicrobiaceae
      • Род Acidimicrobium
  • Порядок Actinomycetales
    • Семейство Actinomycetaceae
      • Роды Actinobaculum, Actinomyces, Arcanobacterium, Falcivibrio, Mobiluncus, Varibaculum
    • Семейство Actinospicaceae
      • Род Actinospica
    • Семейство Catenulisporaceae
      • Род Catenulispora
    • Семейство Corynebacteriaceae
      • Роды Bacterionema, Caseobacter, Corynebacterium
    • Семейство Dietziaceae
      • Род Dietzia
    • Семейство Gordoniaceae
      • Роды Gordonia, Millisia, Skermania
    • Семейство Mycobacteriaceae
      • Род Mycobacterium
    • Семейство Nocardiaceae
      • Роды Micropolyspora, Nocardia, Rhodococcus, Smaragdicoccus
    • Семейство Segniliparaceae
      • Род Segniliparus
    • Семейство Tsukamurellaceae
      • Род Tsukamurella
    • Семейство Williamsiaceae
      • Род Williamsia
    • Семейство Acidothermaceae
      • Род Acidothermus
    • Семейство Kineosporiaceae
      • Роды Cryptosporangium, Kineococcus, Kineosporia
    • Семейство Frankiaceae
      • Род Frankia
    • Семейство Geodermatophilaceae
      • Роды Blastococcus, Geodermatophilus, Modestobacter
    • Семейство Nakamurellaceae
      • Роды Humicoccus, Nakamurella, Quadrisphaera, Saxeibacter
    • Семейство Sporichthyaceae
      • Род Sporichthya
    • Семейство Glycomycetaceae
      • Роды Glycomyces, Stackebrandtia
    • Семейство Beutenbergiaceae
      • Роды Beutenbergia, Georgenia, Salana
    • Семейство Bogoriellaceae
      • Род Bogoriella
    • Семейство Brevibacteriaceae
      • Род Brevibacterium
    • Семейство Cellulomonadaceae
      • Роды Actinotalea, Cellulomonas, Oerskovia, Tropheryma
    • Семейство Dermabacteraceae
      • Роды Brachybacterium, Dermabacter
    • Семейство Dermacoccaceae
      • Роды Demetria, Dermacoccus, Kytococcus
    • Семейство Dermatophilaceae
      • Роды Dermatophilus, Kineosphaera
    • Семейство Intrasporangiaceae
      • Роды Arsenicicoccus, Humibacillus, Humihabitans, Intrasporangium, Janibacter, Knoellia, Kribbia, Lapillicoccus, Ornithinicoccus, Ornithinimicrobium, Oryzihumus, Phycicoccus, Serinicoccus, Terrabacter, Terracoccus, Tetrasphaera
    • Семейство Jonesiaceae
      • Род Jonesia
    • Семейство Microbacteriaceae
      • Роды Agreia, Agrococcus, Agromyces, Aureobacterium, Clavibacter, Cryobacterium, Curtobacterium, Frigoribacterium, Frondicola, Gulosibacter, Humibacter, Labedella, Leifsonia, Leucobacter, Microbacterium, Microcella, Microterricola, Mycetocola, Okibacterium, Phycicola, Plantibacter, Pseudoclavibacter, Rathayibacter, Rhodoglobus, Salinibacterium, Subtercola, Yonghaparkia, Zimmermannella
    • Семейство Micrococcaceae
      • Роды Acaricomes, Arthrobacter, Citricoccus, Kocuria, Micrococcus, Nesterenkonia, Renibacterium, Rothia, Stomatococcus, Zhihengliuella
    • Семейство Promicromonosporaceae
      • Роды Cellulosimicrobium, Isoptericola, Myceligenerans, Promicromonospora, Xylanibacterium, Xylanimonas
    • Семейство Rarobacteraceae
      • Род Rarobacter
    • Семейство Sanguibacteraceae
      • Род Sanguibacter
    • Семейство Yaniellaceae
      • Род Yaniella
    • Семейство Micromonosporaceae
      • Роды Actinocatenispora, Actinoplanes, Amorphosporangium, Ampullariella, Asanoa, Catellatospora, Catelliglobosispora, Catenuloplanes, Couchioplanes, Dactylosporangium, Hamadaea, Krasilnikovia, Longispora, Luedemannella, Micromonospora, Pilimelia, Planopolyspora, Planosporangium, Polymorphospora, Pseudosporangium, Salinispora, Spirilliplanes, Verrucosispora, Virgisporangium
    • Семейство Nocardioidaceae
      • Роды Actinopolymorpha, Aeromicrobium, Friedmanniella, Hongia, Kribbella, Marmoricola, Micropruina, Nocardioides, Pimelobacter, Propionicicella, Propionicimonas
    • Семейство Propionibacteriaceae
      • Роды Aestuariimicrobium, Arachnia, Brooklawnia, Granulicoccus, Jiangella, Luteococcus, Microlunatus, Propionibacterium, Propioniferax, Propionimicrobium, Tessaracoccus
    • Семейство Actinosynnemataceae
      • Роды Actinokineospora, Actinosynnema, Lechevalieria, Lentzea, Saccharothrix, Umezawaea
    • Семейство Pseudonocardiaceae
      • Роды Actinoalloteichus, Actinobispora, Actinomycetospora, Actinopolyspora, Allokutzneria, Amycolata, Amycolatopsis, Crossiella, Faenia, Goodfellowiella, Kibdelosporangium, Kutzneria, Prauserella, Pseudoamycolata, Pseudonocardia, Saccharomonospora, Saccharopolyspora, Streptoalloteichus, Thermobispora, Thermocrispum
    • Семейство Streptomycetaceae
      • Роды Actinopycnidium, Actinosporangium, Chainia, Elytrosporangium, Kitasatoa, Kitasatospora, Microellobosporia, Streptacidiphilus, Streptomyces, Streptoverticillium
    • Семейство Nocardiopsaceae
      • Роды Nocardiopsis, Streptomonospora, Thermobifida
    • Семейство Streptosporangiaceae
      • Роды Acrocarpospora, Herbidospora, Microbispora, Microtetraspora, Nonomuraea, Planobispora, Planomonospora, Planotetraspora, Sphaerisporangium, Streptosporangium, Thermopolyspora
    • Семейство Thermomonosporaceae
      • Роды Actinocorallia, Actinomadura, Excellospora, Spirillospora, Thermomonospora
    • «Actinomycetales», Роды incertae sedis Demequina, Ruania, Fodinicola
  • Порядок Bifidobacteriales
    • Семейство Bifidobacteriaceae
      • Роды Aeriscardovia, Alloscardovia, Bifidobacterium, Gardnerella, Metascardovia, Parascardovia, Scardovia
    • Род incertae sedis Turicella
  • Порядок Coriobacteriales
    • Семейство Coriobacteriaceae
      • Роды Adlercreutzia, Asaccharobacter, Atopobium, Collinsella, Coriobacterium, Cryptobacterium, Denitrobacterium, Eggerthella, Olsenella, Slackia
  • Порядок Rubrobacterales
    • Семейство Conexibacteraceae
      • Род Conexibacter
    • Семейство Patulibacteraceae
      • Род Patulibacter
    • Семейство Rubrobacteraceae
      • Род Rubrobacter
    • Семейство Solirubrobacteraceae
      • Род Solirubrobacter
    • Семейство Thermoleophilaceae
      • Род Thermoleophilum
  • Порядок Sphaerobacterales
    • Семейство Sphaerobacteraceae
      • Род Sphaerobacter

Микробиология: Бактерии
Патогенные бактерии	Бактериальное заражение Колитоксины Экзотоксины Лизогенный цикл
Микрофлора человека	Микрофлора кишечника Микрофлора кожи Микрофлора влагалища Микробиота слизистой глаз Микробиота жёлчных путей Микробиота полости рта
Субстратная специфичность	Липофилы Осмофилы
Дыхание	Аэробы Облигатные Анаэробы Факультативные Облигатные Микроаэрофилы Нанаэробы
Генетика и размножение	Деление прокариотических клеток Конъюгация у бактерий Трансформация Трансдукция Мерозигота Бактериофаги Профаг Плазмиды F-плазмида R-плазмида Плазмиды бактериоциногенности Hly-плазмиды Ent-плазмиды Плазмиды антигенов колонизации Плазмиды деградации
Покоящиеся формы	Эндоспоры Экзоспоры Цисты Миксоспоры Акинеты Бактероиды
См. также	Биоплёнка Гормогонии Гетероцисты