O Inquisidor-Geral ou Grande-Inquisidor (em Latim Inquisitor Generalis) era a máxima autoridade oficial da Inquisição. O mais famoso foi provavelmente o espanhol Tomás de Torquemada, religioso dominicano.

Os seguintes indivíduos desempenharam o cargo de inquisidores-gerais de Espanha entre 1483 e 1834:

• Tomás de Torquemada (1483-1498), prior de Santa Cruz
• Diego de Deza (1498-1507), arcebispo de Sevilha. Renunciou.

Separação das Inquisições de Castela e de Aragão

Castela:

• Francisco Jiménez de Cisneros (1507-1517), cardeal e arcebispo de Toledo primaz das Espanhas.

Aragão:

• Juan Enguera (1507-1513), bispo de Vic.
• Luis Mercader (1512-1516), bispo de Tortosa.
• Adriano de Utrecht (1516-1517), cardeal e bispo de Tortosa.

Reunificação das Inquisições de Castela e de Aragão:

• Adriano de Utrecht (1517-1522), cardeal e bispo de Tortosa.
• Alfonso Manrique de Lara (1523-1538), cardeal e arcebispo de Sevilha.
• Juan Pardo de Tavera (1539-1545), arcebispo de Toledo primaz das Espanhas.
• Juan García de Loaysa y Mendoza (1546), arcebispo de Sevilha.
• Fernando Valdés (1547-1566), arcebispo de Sevilha. Renunciou em 1566.
• Diego de Espinosa (1567-1572), bispo de Sigüenza.
• Gaspar de Quiroga y Vela (1573-1594), cardeal e arcebispo de Toledo primaz das Espanhas.
• Jerónimo Manrique de Lara (1595), bispo de Ávila.
• Pedro de Portocarrero (1596-1599), bispo de Calahorra e bispo de Córdova. Renunciou.
• Fernando Niño de Guevara (1599-1602), cardeal e arcebispo de Sevilha. Renunciou.
• Juan de Zúñiga (1602), bispo de Cartagena.
• Juan Bautista de Acevedo (1603-1608), arcebispo in partibus infidelium.
• Bernardo de Sandoval y Rojas (1608-1618), cardeal e arcebispo de Toledo primaz das Espanhas.
• Luis de Aliaga (1619-1621), confesor real de Filipe III de Espanha. Renunciou.
• Andrés Pacheco (1622-1626), bispo de Cuenca.
• Antonio de Zapata (1627-1632), cardeal e arcebispo de Burgos. Renunciou.
• Antonio de Sotomayor (1632-1643), arcebispo de Damasco.
• Diego de Arce y Reinoso (1643-1665), bispo de Plasência.
• Pascual de Aragón (1665), arcebispo de Toledo primaz das Espanhas. Renunciou.
• Juan Everardo Nithard, S.J. (1666-1669), confessor do rei Filipe IV de Espanha, cardeal e arcebispo de Edessa. Renunciou.
• Diego Sarmiento de Valladares (1669-1695), bispo de Plasência.
• Juan Tomás de Rocabert (1695-1699), arcebispo de Valência.
• Baltasar de Mendoza y Sandoval (1699-1705), bispo de Segóvia. Renunciou.
• Vidal Marín (1705-1709), bispo de Ceuta primaz de África.
• Antonio Ibañes de la Riva Herrera (1709-1710), arcebispo de Saragoça.
• Francisco Giudice (1711-1716), cardeal. Renunciou.
• José de Molines (1717), auditor da Rota Romana.
• Felipe de Arcemendi (1718), proposto por Filipe V de Espanha, não chegou a tomar posse do cargo.
• Diego de Astorga y Céspedes (1720), bispo de Barcelona. Renunciou.
• Juan de Camargo (1720-1733), bispo de Pamplona.
• Andrés de Orbe y Larreátegui (1733-1740), arcebispo de Valência.
• Manuel Isidro Manrique de Lara (1742-1746), arcebispo de Santiago de Compostela.
• Francisco Pérez de Prado y Cuesta (1746-1755), bispo de Teruel.
• Manuel Quintano Bonifaz (1755-1774), arcebispo de Farsala. Renunciou.
• Felipe Beltrán (1775-1783), bispo de Salamanca.
• Agustín Rubín de Ceballos (1784-1793), bispo de Jaén.
• Manuel Abad y Lasierra (1793-1794), bispo de Astorga e arcebispo de Selimbria.
• Francisco Antonio de Lorenzana (1794-1797), cardeal e arcebispo de Toledo primaz das Espanhas. Renunciou.
• Ramón José de Arce (1798-1808), arcebispo de Burgos e arcebispo de Saragoça. Renunciou.
• Francisco J. Mier y Campillo (1814-1818), bispo de Almeria.
• Cristóbal Bencomo y Rodríguez (1818), arcebispo titular de Heraclea, confessor do rei Fernando VII de Espanha (o cargo foi rejeitado pelo próprio Cristóbal Bencomo y Rodríguez).^[1]
• Jerónimo Castellón y Salas (1818-1820), bispo de Tarazona.

• D. Diogo da Silva (1536-1539), desembargador da Casa da Suplicação, confessor de D. João III de Portugal, bispo de Ceuta primaz de África e arcebispo de Braga primaz das Espanhas.
• Cardeal D. Henrique (1539-1579), cardeal e arcebispo de Braga primaz das Espanhas, duas vezes arcebispo de Évora e arcebispo de Lisboa. Veio a ser rei de Portugal.
• D. Manuel de Meneses (1578, enquanto coadjutor de D. Henrique), bispo de Lamego e bispo de Coimbra conde de Arganil. Não chegou a suceder ao Cardeal D. Henrique, porque faleceu em África, na Batalha de Alcácer-Quibir em 4 de Agosto de 1578, onde acompanhara o rei D. Sebastião I de Portugal na qualidade de Enfermeiro-Mor.
• D. Jorge de Almeida (1580-1585), arcebispo de Lisboa.
• Cardeal Alberto de Habsburgo (1586-1593), cardeal e arcebispo de Toledo primaz das Espanhas. Arquiduque de Áustria, Vice-Rei de Portugal e Governador dos Países Baixos Espanhóis.
• D. António de Matos de Noronha (1596-1602), bispo de Elvas.
• D. Jorge de Ataíde (1602), capelão-mor de D. Filipe I de Portugal e por duas vezes vice-rei de Portugal. Indicado para o cargo e nomeado pelo Papa Clemente VIII, mas recusou a posse.
• D. Alexandre de Bragança, (1602-1604) arcebispo de Évora.
• D. Pedro de Castilho (1605-1615), capelão-mor de D. Filipe II de Portugal.
• D. Fernão Martins de Mascarenhas (1615-1628), bispo do Algarve em Faro.
• D. Francisco de Castro, (1630-1653) bispo da Guarda. Reitor da Universidade de Coimbra.
• D. Sebastião César de Meneses (1663-1668). Indicado pelo rei D. Afonso VI de Portugal como inquisidor-geral, mas não nomeado pelo Papa Alexandre VII devido à falta de reconhecimento do Estado português pela Santa Sé.
• D. Pedro de Lencastre (1671-1673), arcebispo de Braga primaz das Espanhas e Duque de Aveiro e Marquês de Torres Novas.
• D. Veríssimo de Lencastre (1676-1692), arcebispo de Braga primaz das Espanhas.
• D. Frei José de Lencastre (1693-1705), bispo de Miranda e bispo de Leiria. Membro do Conselho de Estado.
• D. Nuno da Cunha e Ataíde (1707-1750), capelão-mor dos reis D. Pedro II de Portugal e D. João V de Portugal.
• D. José de Bragança (1758-1760), filho bastardo de D. João V de Portugal.
• D. João Cosme da Cunha (1770-1783), governador das Justiças e membro do Conselho de Estado.
• Frei Inácio de São Caetano (1787-1788), arcebispo, ministro de Estado e do Despacho, confessor de D. Maria I de Portugal e D. Pedro III de Portugal.
• D. José Maria de Melo (1790-1818), bispo do Algarve em Faro, e confessor da rainha D. Maria I de Portugal.
• D. José Joaquim da Cunha Azeredo Coutinho (1818-1821), bispo de Elvas.^[2]

• 
  D. Diogo da Silva
• 
  Cardeal D. Henrique
• 
  D. Manuel de Meneses
• 
  D. Jorge de Almeida
• 
  Cardeal D. Alberto de Habsburgo
• 
  D. Jorge de Ataíde
• 
  D. Pedro de Castilho
• 
  D. Fernão Martins de Mascarenhas
• 
  D. Francisco de Castro
• 
  D. Veríssimo de Lencastre
• 
  D. Nuno da Cunha e Ataíde
• 
  D. José de Bragança
• 
  D. João Cosme da Cunha
• 
  Frei Inácio de São Caetano
• 
  D. José Maria de Melo
• 
  D. José Joaquim da Cunha Azeredo Coutinho

Referências

• PÉREZ VILLANUEVA, Joaquín, e ESCANDELL BONET, Bartolomé - "Historia de la Inquisición en España y América. I: El conocimiento científico y el proceso histórico de la Institución (1478-1834)". Madrid: Biblioteca de Autores Cristianos, 1984. ISBN 84-2201-158-1