비교생리학(Comparative physiology)은 다양한 종류의 유기체의 기능적 특성의 다양성을 연구하고 활용하는 생리학의 하위 분야이다. 진화생리학과 환경생리학과 밀접한 관련이 있다. 많은 대학에서 동물 생리학의 비교 측면을 다루는 학부 과정을 제공한다. 클리포드 래드 프로서(Clifford Ladd Prosser)에 따르면 비교 생리학은 정의된 학문이 아니라 관점, 철학이다.

원래 이 분야의 최근 역사에서 서술된 바와 같이, 생리학은 주로 인간에 초점을 맞추었고, 대부분 의료 관행을 개선하려는 욕구에서 비롯되었다. 생리학자들이 처음으로 서로 다른 종을 비교하기 시작했을 때 유기체가 어떻게 작동하는지 이해하려는 단순한 호기심에서 비롯된 경우도 있었지만 기본적인 생리학적 원리를 발견하려는 욕구에서 비롯되기도 했다. 특정 질문을 연구하는 데 편리한 특정 유기체의 사용은 크로그(Krogh) 원리로 알려져 있다.

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