Se conforma de tres (3) franjas iguales, manifestando equilibrio entre los tres (3) elementos representados en los colores Verde, Blanco y Azul: El Verde: Color de las montañas y matiz del paisaje que nos rodea. Representa la riqueza vegetal definida en lo que el municipio puede producir a través de su agricultura y la exuberancia y abundancia de flora y fauna que habitan nuestro bosque húmedo tropical. El Blanco: Simboliza la pureza y la nobleza de sus habitantes. Representa la armonía y paz que se puede gozar en el municipio. El Azul: Simboliza el color del cielo y la claridad de las aguas que posee el municipio. Representa la riqueza hídrica de donde se genera el 10% de la energía del país y plantea un gran potencial turístico. El Amarillo: Es un haz de luz que representa el potencial eléctrico que convierte a Santa María en el “Centro Hidroeléctrico de Colombia”.

Colores usados: B, W, V y Y.