第43回日本ラグビーフットボール選手権大会は2006年（平成18年）2月4日から2月26日まで近鉄花園ラグビー場及び秩父宮ラグビー場で行われた日本ラグビーフットボール選手権大会である。同点による両チーム優勝で東芝府中ブレイブルーパスが2年ぶり5回目の優勝を果たし、NECグリーンロケッツは2年連続3回目の優勝を果たした。

出場資格は以下の通り（第42回と同じ）。

• 当該年度のトップリーグ、マイクロソフトカップ･トップ8トーナメントで優勝したチーム(※)
• それ以外のトップリーグで上位に入ったチーム(※)
• 入れ替え戦「トップチャレンジシリーズ」の1位プレーオフ（トップ・チャレンジ1）で優勝したチーム
• 全国クラブ選手権優勝チーム
• 全国大学選手権の優勝、準優勝チーム

(※)トップリーグ枠はリーグ戦の原則上位3チームであるが、リーグ戦上位3チームのいずれかがマイクロソフトカップに優勝した場合には、トップリーグ4位のチームが繰り上げ出場の権利を得る。同一チームがトップリーグとマイクロソフトカップの2冠を制した場合はトップリーグ2位のチームがマイクロソフトカップ優勝枠扱いで出場できる。

これによりトーナメントの方式も一部変更され準決勝までは4チームずつのステップラダー方式を取り入れる。

• 1回戦は全国大学選手権優勝チームと全国クラブ選手権チーム、全国大学選手権準優勝チームとトップチャレンジ1優勝チームが対戦。
• 2回戦は1回戦の勝者とトップリーグの上位チーム（トップリーグ優勝、マイクロソフトカップ優勝チーム以外）が対戦。
• その勝者とトップリーグ優勝チーム、マイクロソフトカップ優勝チームとで準決勝を行い、更にその勝者同士で決勝戦を行う。

8チーム

• 東芝府中ブレイブルーパス(トップリーグ優勝)
• 三洋電機ワイルドナイツ(マイクロソフトカップ優勝)^[1]
• NECグリーンロケッツ(トップリーグ3位)
• トヨタ自動車ヴェルブリッツ(トップリーグ4位)
• コカ・コーラウエストジャパン(トップリーグチャレンジシリーズ・1位チーム)
• 早稲田大学(第42回全国大学選手権大会優勝校)
• 関東学院大学(第42回全国大学選手権大会準優勝校)
• タマリバクラブ(第13回全国クラブ大会優勝チーム)

2月4日(土）

秩父宮ラグビー場　第1試合

• コカ・コーラウエストジャパン 12-7 関東学院大学

秩父宮ラグビー場　第2試合

• 早稲田大学 47-7 タマリバクラブ

2月12日(日)

秩父宮ラグビー場　第1試合

• コカ・コーラウエストジャパン 14-64 NECグリーンロケッツ

秩父宮ラグビー場　第2試合

• トヨタ自動車ヴェルブリッツ 24-28 早稲田大学^[2]

2月19日(日)

秩父宮ラグビー場

• 東芝ブレイブルーパス 43-0 早稲田大学

近鉄花園ラグビー場

• NECグリーンロケッツ 24-16 三洋電機ワイルドナイツ

FB 15 松田努 RW 14 廣瀬俊朗 OC 13 冨岡鉄平 () IC 12 スコット・マクラウド LW 11 ナタニエラ・オト FH 10 日原大介 SH 9 吉田朋生 N8 8 ニコラス・ホルテン OF 7 中居智昭 BF 6 渡邉泰憲 RL 5 横山恒雄 LL 4 大野均 TP 3 笠井建志 HK 2 松尾大樹 LP 1 高橋寛 リザーブ: 16 猪口拓 17 大室歩 18 望月雄太 19 ルアタンギ・バツベイ 20 島崎正吾 21 シオネ・ケプ 22 吉田大樹 Coach: 薫田真広

FB 15 武井敬司 RW 14 窪田幸一郎 OC 13 水田雄也 IC 12 向山昌利 LW 11 シェイン・オースティン FH 10 安藤栄次 SH 9 辻高志 N8 8 箕内拓郎 OF 7 グレン・マーシュ BF 6 大東毅 RL 5 熊谷皇紀 LL 4 浅野良太 () TP 3 東考三 HK 2 網野正大 LP 1 久富雄一 リザーブ: 16 水山尚範 17 猪瀬佑太 18 佐藤平 19 セミシ・サウカワ 20 藤戸恭平 21 松尾健 22 百村彰二郎 Coach: 高岩映善

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