妙雲寺、玅雲寺（みょううんじ）

• 妙雲寺 (北海道白糠町) – 北海道白糠郡白糠町にある日蓮宗の寺院。瑞光山妙雲寺。^[1]
• 妙雲寺 (福島県只見町) – 福島県南会津郡只見町塩ノ岐字下八乙女にある真宗高田派の寺院。幽遠山妙雲寺。隣接する御蔵入三十三観音2番札所「塩ノ岐・八乙女堂」（八乙女観音堂）の観音像は妙雲寺で保管^[2]
• 妙雲寺 (水戸市) – 茨城県水戸市見川二丁目にある日蓮宗の寺院。大慧山妙雲寺^[3]
• 妙雲寺 (那須塩原市) – 栃木県那須塩原市塩原にある臨済宗妙心寺派の寺院。甘露山妙雲寺。本堂および内陣の宮殿は市指定有形文化財^[4]
• 妙雲寺 (台東区) – 東京都台東区谷中にある日蓮宗の寺院。瑞應山妙雲寺。^[5]
• 妙雲寺 (大田区) – 東京都大田区池上にある日蓮宗の寺院。玄性山妙雲寺。^[6]
• 妙雲寺 (見附市) – 新潟県見附市坂井町にある曹洞宗の寺院。龍谷山玅雲寺。坂井館址、廣川山專正寺の北に位置。^[7]
• 妙雲寺 (岐阜県川辺町) – 岐阜県加茂郡川辺町中川辺にある本門法華宗の寺院。大圓山妙雲寺。
• 妙雲寺 (浜松市浜名区) – 静岡県浜松市浜名区神宮寺町（もと引佐町井伊谷）にある臨済宗妙心寺派の寺院。浩德山妙雲寺。井伊直虎の院号から命名。
• 妙雲寺 (浜松市天竜区) – 静岡県浜松市天竜区二俣町鹿島にある日蓮宗の寺院。成就山妙雲寺。^[8]
• 妙雲寺 (津市) – 三重県津市乙部にある天台宗の寺院^[9]
• 妙雲寺 (高島市) – 滋賀県高島市安曇川町川島にある日蓮宗の寺院。普潤山妙雲寺。本満寺末。^[10]
• 妙雲寺 (福知山市) – 京都府福知山市大江町河守にある日蓮宗の寺院。見河山妙雲寺、河守妙雲寺^[11]
• 妙雲寺 (藤井寺市) – 大阪府藤井寺市古室一丁目にある真宗大谷派の寺院
• 妙雲寺 (出雲市) – 島根県出雲市天神町にある日蓮宗の寺院。西龍山妙雲寺。^[12]
• 妙雲寺 (益田市) – 島根県益田市白上町にある浄土宗の寺院。白上山中嶋院妙雲寺。^[13]
• 妙雲寺 (西条市) – 愛媛県西条市小松町妙口字甲（周敷郡妙口村、周桑郡石根村妙口）にある高野山真言宗の寺院。石鈇山極樂院妙雲寺。新四国曼荼羅霊場第34番
• 妙雲寺 (竹田市) – 大分県竹田市荻町馬場にある真宗大谷派の寺院^[14]
• 妙雲寺 (福岡県遠賀町) – 福岡県遠賀郡遠賀町老良（筑前国遠賀郡広渡村枝村老良村、島門村広渡老良）にある浄土真宗本願寺派の寺院。沖塚山妙雲寺。老良神社の南に位置する。^[15]
• 妙雲寺 (佐賀県吉野ヶ里町) – 佐賀県神埼郡吉野ヶ里町田手にある曹洞宗の寺院。東輝山妙雲寺。^[16]

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