Pengungsi Bhutan (bahasa Inggris: Bhutanese refugees) adalah Lhotshampas ("orang selatan"), sekelompok orang Bhutan berbahasa Nepal. Para pengungsi ini terdaftar di kamp-kamp pengungsi di Nepal timur selama tahun 1990-an sebagai warga Bhutan yang dipaksa keluar dari Bhutan selama protes terhadap tindakan opresif pemerintah Bhutan oleh beberapa Lhotshampa yang menuntut Hak Asasi Manusia dan demokrasi di Bhutan. Karena Nepal dan Bhutan belum menerapkan kesepakatan apa pun tentang repatriasi, banyak pengungsi Bhutan telah bermukim di Amerika Utara, Oseania, dan Eropa di bawah naungan Kantor Komisaris Tinggi PBB untuk Pengungsi (United Nations High Commissioner for Refugees, UNHCR). Banyak orang Lhotshampa yang juga bermigrasi ke daerah Benggala Barat dan Assam di India yang ditangani secara terpisah dari UNHCR.