Pääsihteeri on johtohenkilö tietyissä organisaatioissa kuten puolueissa.^[1][2][3][4] Pääsihteeri on järjestön toimeenpaneva elimen, sihteeristön johtaja.

Esimerkiksi YK:n^[5] ja Naton johtohenkilöt ovat pääsihteereitä.^[6] Myös monilla muilla monenkeskisillä, monista valtioista muodostuvilla organisaatioilla on pääsihteereitä. Tämä korostaa järjestön monikansallista luonnetta ja sitä, että lopullinen päätöksenteon oikeus on jäsenvaltioilla.^[7][8]

Suomessa joillain kansalaisjärjestöillä on pääsihteeri.^{[9][10][11][12][13][14][15]} Suomen eduskunnalla on pääsihteeri, joka toimii eduskunnan kanslian päällikkönä sekä eduskunnan sihteerinä.^[16]