Ihmisen isälinjan haplotyyppi on ihmisen Y-kromosomista määritetty perimän tyyppi. Se määritetään geenitutkimuksella. Haplotyyppi ilmaistaan numero- ja kirjainyhdistelmällä. Suomalaisten isälinjan haplotyyppi on yleisimmin N1c tai I1d. Afrikassa eli kivikaudella isälinjan Aatami, josta kaikki maailman ihmiset ovat osaltaan lähtöisin.

• Haploryhmä A (M91) (Afrikassa, varsinkin khoisan-kansoilla ja nilooteilla)
• Haploryhmä B (M60) (Afrikassa, varsinkin pygmeillä ja hadzoilla)

(mutaatio M168 tapahtui noin 50 000 vuotta sitten)

• Haploryhmä C (M130) (Oseaniassa, Pohjois-, Keski- ja Itä-Aasiassa, Pohjois Amerikassa ja vähemmän Etelä-Amerikassa, Etelä- ja Länsi-Aasiassa sekä Euroopassa)
• YAP+ Haploryhmä
  • Haploryhmä DE (M1, M145, M203)
    • Haploryhmä D (M174) (Tiibetissä, Japanissa, Andamaanien saarilla)
    • Haploryhmä E (M96)
      • Haploryhmä E1b1a (V38) Länsi-Afrikassa ja ympäröivillä alueilla. Tunnuksena myös E3a.
      • Haploryhmä E1b1b (M215) Itä- ja Pohjois-Afrikassa, Keski-idässä, Välimerenmaissa ja Balkanilla. Aiemmin tunnettu tunnuksella E3b

(mutaatio M89 tapahtui noin 45,000 vuotta sitten)

• Haploryhmä F (M89) Oseaniassa, Euroopassa, Aasiassa, Pohjois- ja Etelä-Amerikassa
  • Haploryhmä FT (P14, M213) (Etelä-Intiassa, Sri Lankassa ja Kiinassa)
• Haploryhmä G (M201) (Monilla Euraasian kansoilla, mutta harvinainen; yleisin Kaukasuksella, Iranin tasangolla ja Turkissa, Euroopassakin Kreikassa, Italiassa, Espanjassa, Portugalissa, Tirolissa ja Tšeikissä. Erittäin harvinainen Pohjois-Euroopassa)
• Haploryhmä H (M69) (Intia, Sri Lanka, Nepal, Pakistan, Iran, Keski-Aasia, ja Arabia)
• Haploryhmä IJK (L15, L16)

• Haploryhmä IJK (L15, L16)
  • Haploryhmä IJ (S2, S22)
    • Haploryhmä I (M170, P19, M258) (yleisesti Euroopassa, jonkin verran myös Lähi-idässä, ei juurikaan muualla^[1])
      • Haploryhmä I1 (M253, M307, P30, P40) (Pohjois-Euroopassa, hallitseva Skandinaviassa)
      • Haploryhmä I2 (S31) (Keski- ja kaakkois-Euroopassa sekä Sardiniassa)
    • Haploryhmä J (M304) (Lähi-idässä, Turkissa, Kaukasuksella, Italiassa, Kreikassa, Balkanilla, Pohjois- ja Koillis-Afrikassa)
      • Haploryhmä J* (Pääosin Sokotrassa, muutamia hajalöydöksiä Pakistanissa, Omanissa, Kreikassa, Tšekissä ja turkinsukuisilla kansoilla)
      • Haploryhmä J1 (M267) (Pääasiassa seemiläisillä kansoilla Lähi-idässä, Etiopiassa ja Pohjois-Afrikassa; myös Iranissa, Pakistanissa ja Intiassa, varsinkin Dagestanin indoeurooppalaisilla kansoilla; J1 yhdessä DYS388=13:n kanssa esiintyy pääasiassa Itä-Anatoliassa.
      • Haploryhmä J2 (M172) (Esiintyy pääasiassa Länsi- ja Keski-Aasiassa, Etelä-Euroopassa ja Pohjois-Afrikassa)
  • Haploryhmä K (M9, P128, P131, P132)

(mutaatio M9 tapahtui noin 40 500 vuotta sitten)

• Haploryhmä K
  • Haploryhmä LT (L298/P326)
    • Haploryhmä L (M11, M20, M22, M61, M185, M295) (Etelä-, Keski- ja Lounais-Aasiassa sekä Välimeren maissa)
    • Haploryhmä T (M70, M184/USP9Y+3178, M193, M272) (Pohjois-Afrikassa, Afrikan sarvessa, Lounais-Aasiassa, Välimeren maissa ja Etelä-Aasiassa) tunnettiin haploryhmänä K2
  • Haploryhmä K(xLT) (rs2033003/M526)

• • Haploryhmä M (P256) (Uusi-Guinea, Melanesia, Indonesian itäosat)
  • Haploryhmä NO (M214)
    • Haploryhmä N (M231) (Pohjoisimmassa Euraasiassa, varsinkin uralilaisilla kansoilla
    • Haploryhmä O (M175) (Etelä-, länsi-, itä- ja lounais-Aasiassa sekä Tyynenmeren eteläosan saarilla)
      • Haploryhmä O1 (MSY2.2)
      • Haploryhmä O2 (P31, M268)
      • Haploryhmä O3 (M122)
  • Haploryhmä P-M45 (M45) (M45-mutaatio tapahtui noin 35 000 vuotta sitten)
    • Haploryhmä Q-M242 (M242) (tapahtui noin 15 000-20 000 vuotta sitten. Esiintyy Aasiassa sekä Pohjois- ja Etelä-Amerikassa.)
      • Haploryhmä Q-M3 (M3) (Pohjois-, Keski- ja Etelä-Amerikassa)
    • Haploryhmä R (M207)
      • Haploryhmä R1 (M173)
        • Haploryhmä R1a (M17) (Keski- ja Etelä-Aasiassa sekä Keski-, Pohjois- ja Itä-Euroopassa)
        • Haploryhmä R1b (M343) (Euroopassa, Kaukasuksella, Keski- ja Etelä-Aasiassa, Pohjois- ja Keski-Afrikassa)
      • Haploryhmä R2 (M124) (Etelä-Aasiassa, Kaukasuksella ja Itä-Aasiassa)
  • Haploryhmä S (M230, P202, P204) (Uudessa-Guineassa, Melanesiassa ja Indonesian itäosissa)

Wikimedia Commonsissa on kuvia tai muita tiedostoja aiheesta Ihmisen isälinjan haplotyyppi.

• Haplomaps
• Y-Chromosome Haplogroup maps of West Asia (Arkistoitu – Internet Archive)