El ADN espaciador se encuentra en la cadena de ADN de todos los cromosomas. Son regiones que no se transcriben y se localizan entre genes que sí se transcriben. Su función más probable implica garantizar las elevadas tasas de transcripción asociadas con estos genes.^[1]​ En procariontes el ADN espaciador tiene apenas unos nucleótidos de longitud, mientras que en el ADN eucariota, este ADN espaciador tiene una gran concentración de nucleótidos.

También se denomina ADN espaciador a la región del ADN localizada entre los nucleosomas, como parte de la estructura de la cromatina, y que comprende aproximadamente 20-80 nucleótidos. En el estadio de menor empaquetamiento de la cromatina, esta tiene una estructura característica en forma de "collar de cuentas", en la que los nucleosomas se encuentran dispersos a lo largo del ADN, separados por la región del ADN espaciador.^[2]​

• Espaciador transcrito externo
• Espaciador transcrito interno