Το πρωτάθλημα της ΕΠΣ Αθηνών 1978-79 κατέκτησε ο Διαγόρας Αιγάλεω, ο οποίος αναδείχθηκε υπερπρωταθλητής της Α' Κατηγορίας νικώντας τον πρωταθλητή του Α' ομίλου Αθηναϊκό και ανήλθε έτσι στην Εθνική Ερασιτεχνική κατηγορία, όπως και η ομάδα του Βύρωνα.

Ο Διαγόρας μετείχε στον Β' όμιλο (20 ομάδων) και τερμάτισε στην 1η θέση έπειτα από 38 αγωνιστικές, επιτυγχάνοντας τέρματα 71 υπέρ, 37 κατά και συγκεντρώνοντας 57 βαθμούς.

Τέσσερις βαθμούς πιο πίσω βρέθηκε η Δόξα Βύρωνα, ενώ τρίτος ήταν ο Ήφαιστος Περιστερίου (48 β.)

Μεταξύ των υποβιβασθέντων στη Β' κατηγορία ήταν και ο Ορφέας Αιγάλεω που παλαιότερα είχε αγωνισθεί στη Β' Εθνική.

Στον Α' όμιλο κυριάρχησε ο Αθηναϊκός, μια ιστορική ομάδα γνωστή για την αξιοσημείωτη παρουσία της στην Α' κατηγορία Αθηνών, τόσο της προπολεμικής όσο και της πρώτης μεταπολεμικής περιόδου (δεκαετία του '50). Στις 4 Ιουλίου του 1979 στο γήπεδο της Καλλιθέας δόθηκε ο αγώνας για τον υπερπρωταθλητή, λόγω μεγάλης καθυστέρησης της επικύρωσης της τελικής βαθμολογίας του β' ομίλου, όπου μηδενίσθηκε η Δόξα Βύρωνα. Το παιχνίδι στην κανονική του διάρκεια και στην παράταση τελείωσε ισόπαλο (1-1) και ο Διαγόρας πήρε τον τίτλο στη διαδικασία των πέναλτι.

• Α΄ με 40 ομάδες σε δύο ομίλους των 20 ομάδων.
• Β΄ με 54 ομάδες σε τρεις ομίλους των 18 ομάδων.
• Γ΄ με 48 ομάδες σε τρεις ομίλους των 16 ομάδων.

Μετείχαν 40 ομάδες σε δύο ομίλους. Το πρωτάθλημα μπήκε σε περιπέτεια μετά τον Ιανουάριο, όταν η πρωτοπόρος Δόξα Βύρωνα τιμωρήθηκε με υποβιβασμό, έπειτα από απόπειρα δωροδοκίας που επιχείρησε παράγοντας της ομάδας προς παίκτη του Χολαργού. Ο σύλλογος προσέφυγε στο ΑΣΕΑΔ, το οποίο τον Απρίλιο έβγαλε απόφαση υπέρ της Δόξας θεωρώντας πως δεν έχει ευθύνη ο σύλλογος. Η ομάδα άρχισε να αγωνίζεται και μέχρι να τελεσιδικήσει η υπόθεση υπήρχε το πρωτοφανές να αναγγέλονται δύο βαθμολογίες, μία με τη Δόξα τιμωρημένη και μία με τη Δόξα να αγωνίζεται. Τελικά, στα τέλη Ιουνίου, εβδομάδες μετά τη λήξη των αγώνων, ίσχυσε η αρχική απόφαση και η ομάδα υποβιβάστηκε. Αλλά οι αγώνες κατάταξης έγιναν τον Ιούλιο.

• Α΄ όμιλος (20): Αθηναϊκός, Γ.Σ. Ηλιούπολη, Θρίαμβος Αθηνών, Γ.Σ. Αγ. Αναργύρων, Α.Π.Ο. Ψυχικό, Αθηναΐς Κυψέλης, Α.Ο. Πεύκης, Φοίνικας Καλλιθέας, Π.Α.Ο. Καματερού, Γ.Σ. Καισαριανής, Α.Ο. Χαϊδαρίου, Άρης Πετρούπολης, Ποσειδών Γλυφάδας, Α.Ε. Χαλανδρίου, Α.Π.Ε. Αγ. Ελεούσα, Άρης Βούλας, Α.Π.Ο. Ν. Σμύρνης, Α.Ο. Ωρωπού, Ακράτητος, Λαυρεωτική.
• Β΄ όμιλος (20): Διαγόρας Αιγάλεω, Δόξα Βύρωνα, Ήφαιστος Περιστερίου, Ο.Φ. Χολαργού, Π.Α.Ο. Καλογρέζας, Γ.Σ. Μαρκό, Π.Ο. Αγ. Θωμά Γουδί, Ηρακλής Περιστερίου, Α.Σ. Σούρμενα, Α.Ο. Παγκρατίου, Αττικός, Α.Ο.Ν. Αργυρούπολης, Χαραυγιακός, Α.Ο. Νεάπολη Ν. Ιωνίας, Α.Ο. Δάφνης, Ορφέας Αιγάλεω, Γ.Σ. Πατησίων, Α.Ο. Κηφισιάς, Π.Α.Ο. Αλσούπολη, Α.Ο. Αγ. Παρασκευής.

• Υπερπρωταθλητής: Διαγόρας Αιγάλεω.
  • Νικητής Α΄ ομίλου: Αθηναϊκός
  • Νικητής Β΄ ομίλου: Διαγόρας Αιγάλεω.
  • Τελικός: Διαγόρας Αιγάλεω - Αθηναϊκός: 1-1 (9-8 πεν.).
• Άνοδος στη Εθνική Ερασιτεχνική κατηγορία (2): Διαγόρας Αιγάλεω, Αθηναϊκός
• Υποβιβασμός στη Β΄ ΕΠΣΑ (9): Δόξα Βύρωνα, Π.Α.Ο. Αλσούπολη, Α.Ο. Αγ. Παρασκευής, Ορφέας Αιγάλεω, Α.Π.Ο. Ν. Σμύρνης, Άρης Βούλας, Ακράτητος, Λαυρεωτική, Α.Ο. Κηφισιάς.
• Άνοδος από Β΄ ΕΠΣΑ (9): Κεραυνός Κερατέας, Π.Ο. Ψυχικό, Αρίων Παγκρατίου, Δάφνη Αθηνών, Ατρόμητος Χαλανδρίου, Α.Ο. Κηπούπολης, Π.Α.Σ. Παλαιό Φάληρο, Α.Ο. Τερψιθέα Γλυφάδας, Θεμιστοκλής Αιγάλεω.
  • Υποβιβασμός από Εθνική Ερασιτεχνική κατηγορία (2): Αστέρας Ζωγράφου, Α.Ο. Κορωπί.

Αγωνίστηκαν οι πρωταθλητές των δύο ομίλων Αθηναϊκός και Διαγόρας Αιγάλεω. Νικήτρια αναδείχθηκε η ομάδα του Διαγόρα που κατέκτησε τον τίτλο του υπερπρωταθλητή της ΕΠΣΑ.

• Τετάρτη, 4 Ιουλίου 1979, γήπ. Καλλιθέας.
• Διαγόρας Αιγάλεω - Αθηναϊκός: 1-1 (9-8 πέν.).
• Σκόρερ:

Η 9η ομάδα που υποβιβάστηκε προέκυψε έπειτα από αγώνα μπαράζ ανάμεσα στις δυο ομάδες που τερμάτισαν στη 16η θέση των δύο ομίλων, δηλαδή του Α.Ο. Ωρωπού και του Α.Ο. Κηφισιάς . Νικήτρια αναδείχθηκε η ομάδα του Ωρωπού που παρέμεινε στην κατηγορία.

• Τετάρτη, 4 Ιουλίου 1976, γήπ. Καισαριανής (1000 θεατές):
• Α.Ο. Ωρωπού - Α.Ο. Κηφισιάς: 1-0 (0-0)
• Σκόρερ: Μαργιώλης 66΄.

Μετείχαν 54 ομάδες χωρισμένες σε τρεις ομίλους.

• Α΄ όμιλος (18): Κεραυνός Κερατέας, Π.Ο. Ψυχικού, Αρίων Παγκρατίου, Φωστήρας Καισαριανής, Α.Ο. Κουκουβαούνων, Α.Ε. Μενιδίου, Πανθησειακός, Άφοβος Σεπολίων, Α.Ο. Καλαμακίου, Ιάσων Ν. Λιοσίων, Ακάδημος Κολωνού, Α.Ο. Ν. Φιλαδέλφειας, Βοτανικός, Α.Ο. Υμηττός, Α.Ο. Κουβαράς, Άμυνα Αμεπλοκήπων, Ελπιδοφόρος Κηφισιάς, Αστέρας Εξαρχείων.
• Β΄ όμιλος (18): Δάφνη Αθηνών, Ατρόμητος Χαλανδρίου, Α.Ο. Κηπούπολης, Τριγλία Ραφήνας, Φωστήρας Ηλιούπολης, Α.Ε. Ελευθερούπολης, Α.Ο. Ελληνικών Ναυπηγείων, Κυανούς Αστήρ Βάρης, Άρης Παγκρατίου, Κρόνος Αθηνών, Πανερυθραϊκός, Ο.Φ. Νέας Ιωνίας, Εθνικός Ελληνορώσων, Μάχη Μαραθώνα, Βύρων Βύρωνα, Άμιλλα Περιστερίου, Α.Ο. Παλαιό Ηράκλειο, Α.Ο. Λυκόβρυσης.
• Γ΄ όμιλος (18): Π.Α.Σ. Παλαιό Φάληρο, Α.Ο. Τερψιθέα Γλυφάδας, Θεμιστοκλής Αιγάλεω, Παμπαιανικός, Α.Ο. Βουλιαγμένης, Νίκη Πλάκας, Α.Ο. Μελισσίων, Πέρα Κλουμπ, Α.Ο. Περιστερίου, Α.Ο. Ταταύλα, Αήττητος Σπάτων, Λαρισαϊκός, Πλάτων Αθηνών, Γρανικός, Ένωση Κάτω Πετραλώνων,¹ Αχιλλέας Κ. Αχαρνών, Γ.Σ. Αμαρουσίου, Γ.Σ. Πετραλώνων.

Σημείωση:
¹ Είναι ο πρώην "Παρθενών Κ. Πετραλώνων".

• Υπερπρωταθλητής: Π.Α.Σ. Παλαιό Φάληρο.
• Άνοδος στην Α΄ (9):
  • Α΄ όμιλος: Κεραυνός Κερατέας (πρωταθλητής), Π.Ο. Ψυχικού, Αρίων Παγκρατίου.
  • Β΄ όμιλος: Δάφνη Αθηνών (πρωταθλήτρια), Ατρόμητος Χαλανδρίου, Α.Ο. Κηπούπολης.
  • Γ΄ όμιλος: Π.Α.Σ. Παλαιό Φάληρο (πρωταθλητής), Α.Ο. Τερψιθέα Γλυφάδας, Θεμιστοκλής Αιγάλεω.
• Υποβιβασμός στη Γ΄ (9): Ελπιδοφόρος Κηφισιάς, Αστέρας Εξαρχείων, Άμιλλα Περιστερίου, Α.Ο. Λυκόβρυσης, Αχιλλέας Κ. Αχαρνών, Γ.Σ. Αμαρουσίου, Γ.Σ. Πετραλώνων, Βοτανικός (για απόπειρα δωροδοκίας), Α.Ε. Ελευθερούπολης (για απόπειρα δωροδοκίας). Αρχικά, στη θέση των Βοτανικού, Ελευθερούπολης είχαν υποβιβαστεί η Άμυνα Αμπελ. και ο Α.Ο. Παλ. Ηράκλειο.
• Άνοδος από Γ΄ (9):
  • Α΄ όμιλος: Προμηθέας Δάφνης (πρωταθλητής), Γκυζιακός, Κεραυνός Γλυφάδας.
  • Β΄ όμιλος: Αστραπή Ανθούπολης (πρωταθλήτρια), Α.Ο. Κολωνός, Νέα Ζωή.
  • Γ΄ όμιλος: Α.Ο. Γαλατσίου (πρωταθλητής), Α.Σ. Παπάγου, Παλληνιακός.

Υπερπρωταθλητής Β΄ κατηγορίας αναδείχθηκε ο Π.Α.Σ. Παλαιό Φάληρο έπειτα από αγώνες κατάταξης μεταξύ των πρωταθλητών των τριών ομίλων.

Στο θεσμό του κυπέλλου συμμετέχουν τα σωματεία της Ε.Π.Σ. Αθηνών.

Κυπελλούχος αναδείχθηκε ο Α.Ο. Παγκρατίου.

• Ψηφιακό αρχείο εφ. "Αθλητική Ηχώ".
• "Αθλητική Ηχώ", 28/5/1979.^{[νεκρός σύνδεσμος]}
• "Αθλητική Ηχώ", 3/6/1979.^{[νεκρός σύνδεσμος]}
• "Αθλητική Ηχώ", 5/7/1979.^{[νεκρός σύνδεσμος]}