Fylogenetisk klassifikation af de placentale pattedyr

Molekylærgenetiske studier af DNA har ændret det traditionelle syn på slægtskabet mellem pattedyrfamilierne. Slægtskabstræer baseret på molekylærgenetiske data beskriver tre hovedgrupper eller linjer i placentale pattedyr: Afrotheria, Xenarthra og Boreoeutheria, der blev adskilt i kridttiden.

Slægtskabet mellem de tre hovedgrupper er omdiskuteret og der er således tre mulige hypoteser for hvilken af de tre grupper, der er den basale.

Tidspunktet for adskillelsen af de tre grupper anføres til mellem 105 og 120 millioner år siden, afhængigt af hvilken type DNA der er analyseret (f.eks. kerne-DNA og mitokondriel DNA)^[1] og forskellig tolkning af paleogeografiske data.^[2]

Nedenfor er angivet kladogrammet baseret på Tarver et al. (2016)^[3]

Gruppe I: Overorden Afrotheria^[4]

• Clade Afroinsectiphilia
  • Macroscelidea: elefantspidsmus (Afrika)
  • Afrosoricida: Børstesvin og guldmuldvarpe(Afrika)
  • Tubulidentata: Jordsvin (Afrika syd for Sahara)
• Clade Paenungulata
  • Order Hyracoidea: Klippegrævlinger (Afrika, Mellemøsten)
  • Order Proboscidea: elefanter (Afrika, Sydøstasien)
  • Order Sirenia: Søkøer (tropiske kosmopolitter)

Group II: Superorder Xenarthra (Gumlere)^[4]

• Order Pilosa: Dovendyr og myreslugere (Centralamerika)
• Order Cingulata: Bæltedyr (Amerika)

Group III: Magnaorder Boreoeutheria^[4]

• Superorder: Euarchontoglires (Supraprimates)
  • Grandorder Euarchonta
    • Order Scandentia: træspidsmus (Sydøstasien).
    • Order Dermoptera: Kaguanger (Sydøstasien)
    • Order Primates: Primater (kosmopolitter)
  • Grandorder Glires
    • Order Lagomorpha: Harer, kaniner og pibeharer (Eurasien, Afrika, Amerika)
    • Order Rodentia: Gnavere (kosmopolitter)
• Superorder: Laurasiatheria
  • Order Eulipotyphla: Spidsmus, pindsvin, muldvarpe, solenodont
  • Clade Scrotifera
    • Order Chiroptera: Flagermus (kosmopolitter)
    • Clade Fereuungulata
      • Clade Ferae
        • Order Pholidota: Skældyr (Afrika, Sydøstasien)
        • Order Carnivora: Rovdyr (kosmopolitter)
      • Clade Euungulata
        • Order Cetartiodactyla: hvaler, parrettåede hovdyr
        • Order Perissodactyla: uparrettåede hovdyr

Phylogeny

A phylogeny of living Osteichthyes, including the tetrapods, is shown in the cladogram.^[5][6][7][8]

Whole-genome duplication took place in the ancestral Osteichthyes.^[9]

1. ^ Springer, Mark S.; Murphy, William J.; Eizirik, Eduardo; O'Brien, Stephen J. (2003). "Placental mammal diversification and the Cretaceous–Tertiary boundary". Proceedings of the National Academy of Sciences. 100 (3): 1056-1061. Bibcode:2003PNAS..100.1056S. doi:10.1073/pnas.0334222100. PMC 298725. PMID 12552136.
2. ^ Nishihara, H.; Maruyama, S.; Okada, N. (2009). "Retroposon analysis and recent geological data suggest near-simultaneous divergence of the three superorders of mammals". Proceedings of the National Academy of Sciences. 106 (13): 5235-5240. Bibcode:2009PNAS..106.5235N. doi:10.1073/pnas.0809297106. PMC 2655268. PMID 19286970.
3. ^ Tarver, James E.; dos Reis, Mario; Mirarab, Siavash; Moran, Raymond J.; Parker, Sean; O’Reilly, Joseph E.; King, Benjamin L.; O’Connell, Mary J.; Asher, Robert J.; Warnow, Tandy; Peterson, Kevin J.; Donoghue, Philip C. J.; Pisani, Davide (2016). "The Interrelationships of Placental Mammals and the Limits of Phylogenetic Inference". Genome Biology and Evolution. 8 (2): 330-344. doi:10.1093/gbe/evv261. hdl:1983/64d6e437-3320-480d-a16c-2e5b2e6b61d4. PMC 4779606. PMID 26733575.
4. ^ ^{a b c} Springer, Mark S.; Meredith, Robert W.; Janecka, Jan E.; Murphy, William J. (2011). "The Historical Biogeography of Mammalia". Philosophical Transactions of the Royal Society B. 366 (1577): 2478-2502. doi:10.1098/rstb.2011.0023. PMC 3138613. PMID 21807730.
5. ^ Fodnotefejl: Ugyldigt <ref>-tag; ingen tekst er angivet for referencer med navnet Betancur
6. ^ Betancur-R; et al. (2013). "Complete tree classification (supplemental figure)" (PDF). PLOS Currents Tree of Life (Edition 1). Arkiveret fra originalen (PDF) 2013-10-21.
7. ^ Betancur-R; et al. (2013). "Appendix 2 – Revised Classification for Bony Fishes" (PDF). PLOS Currents Tree of Life (Edition 1).
8. ^ Ricardo Betancur-R; Edward O. Wiley; Gloria Arratia; Arturo Acero; Nicolas Bailly; Masaki Miya; Guillaume Lecointre; Guillermo Ortí (2017). "Phylogenetic classification of bony fishes". BMC Evolutionary Biology. 17 (1): 162. doi:10.1186/s12862-017-0958-3. PMC 5501477. PMID 28683774.
9. ^ Dehal, Paramvir; Boore, Jeffrey L. (2005-09-06). "Two Rounds of Whole Genome Duplication in the Ancestral Vertebrate". PLOS Biology (engelsk). 3 (10): e314. doi:10.1371/journal.pbio.0030314. ISSN 1545-7885. PMC 1197285. PMID 16128622.